19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2347 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2347  putative sulfur oxidation protein DsrH  100 
 
 		 98 aa  200  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377346  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2017  DsrH like protein  31.58 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000931832  hitchhiker  0.000744283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3577  DsrH like protein  31.31 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1333  intracellular sulfur oxidation protein DsrH  28.71 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3340  DsrH family protein  28.57 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171608  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3995  hypothetical protein  28.57 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1838  DsrH family protein  28.57 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000194131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3399  sulfur relay protein TusB/DsrH  26.53 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.439562 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1657  DsrH family protein  28.57 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3170  DsrH like protein  29.29 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225205  normal  0.258355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2601  hypothetical protein  25.49 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691095  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28140  dissimilatory sulfite reductase, DsrH-like protein  26.53 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2379  DsrH family protein  23.47 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764227  normal  0.0193551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30380  hypothetical protein  25.49 
 
 		 101 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2476  sulfur relay protein TusB/DsrH  27.37 
 
 		 93 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656489  hitchhiker  0.0000966631 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1806  DsrH like protein  27 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000305366  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1851  sulfur relay protein TusB/DsrH  27.27 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563388  normal  0.139435 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2454  DsrH family protein  29.13 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000310745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0134  DsrH family protein  28.12 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00043522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>