More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2306 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  100 
 
 		 524 aa  1051    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  55.49 
 
 		 528 aa  600  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000149336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  53.37 
 
 		 542 aa  585  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02051  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  57.18 
 
 		 545 aa  421  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00514196  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0415  sodium/hydrogen exchanger  40.57 
 
 		 559 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1105  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.11 
 
 		 553 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0653  sodium/hydrogen exchanger  43.84 
 
 		 544 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0537  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  42.75 
 
 		 535 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  0.013329 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0513  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.45 
 
 		 528 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3667  sodium/hydrogen exchanger  41.54 
 
 		 556 aa  396  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01333  hypothetical protein  43.22 
 
 		 529 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2640  sodium/hydrogen exchanger  42.88 
 
 		 535 aa  395  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004131  putative Glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.69 
 
 		 529 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3267  sodium/hydrogen exchanger  41.96 
 
 		 542 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.389403  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0828  sodium/hydrogen antiporter  42.64 
 
 		 527 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1223  sodium/hydrogen exchanger  42.61 
 
 		 531 aa  385  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0693873  normal  0.0816945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4016  sodium/hydrogen exchanger  42.39 
 
 		 541 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000212571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3248  sodium/hydrogen exchanger  42.31 
 
 		 547 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0662  sodium/hydrogen exchanger  43.3 
 
 		 551 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3727  sodium/hydrogen exchanger  43.11 
 
 		 551 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0635  sodium/hydrogen exchanger  43.3 
 
 		 551 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0545  sodium/hydrogen exchanger  42.91 
 
 		 545 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408022  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0658  sodium/hydrogen exchanger  42.91 
 
 		 551 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0582  sodium/hydrogen exchanger  41.81 
 
 		 552 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0695  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  42.23 
 
 		 547 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1189  sodium/hydrogen exchanger  41.75 
 
 		 534 aa  365  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3407  sodium/hydrogen exchanger  42.53 
 
 		 545 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.792145  normal  0.0393803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3577  sodium/hydrogen exchanger  41.97 
 
 		 547 aa  365  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549647 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3453  sodium/hydrogen exchanger  36.02 
 
 		 523 aa  292  8e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2255  sodium/hydrogen exchanger  37.98 
 
 		 520 aa  263  6.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  27.76 
 
 		 551 aa  153  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 		 572 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  25.5 
 
 		 558 aa  146  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  25.94 
 
 		 595 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  26.55 
 
 		 565 aa  144  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  25.63 
 
 		 566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  25.68 
 
 		 662 aa  140  7e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  27.29 
 
 		 546 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  25.73 
 
 		 566 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  25.43 
 
 		 566 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 		 541 aa  136  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 		 575 aa  136  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  27.14 
 
 		 562 aa  128  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  27.05 
 
 		 682 aa  127  7e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1236  potassium efflux system protein  26.03 
 
 		 589 aa  126  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  25.61 
 
 		 548 aa  127  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  23.89 
 
 		 575 aa  126  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  26.12 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  25.56 
 
 		 616 aa  124  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  25.58 
 
 		 648 aa  124  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  26.51 
 
 		 589 aa  124  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  26.51 
 
 		 589 aa  123  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.73 
 
 		 589 aa  123  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  25.73 
 
 		 589 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  24.08 
 
 		 649 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.28 
 
 		 671 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  25.29 
 
 		 649 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  25.24 
 
 		 648 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  25.24 
 
 		 648 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  27.31 
 
 		 566 aa  119  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0528  potassium efflux system protein  25.33 
 
 		 604 aa  120  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  25.24 
 
 		 648 aa  120  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  25.43 
 
 		 648 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  26.21 
 
 		 720 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  24.22 
 
 		 649 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3045  potassium efflux system protein  25.98 
 
 		 589 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.268966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1305  potassium efflux system protein  25.98 
 
 		 589 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00534275  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  24.05 
 
 		 563 aa  118  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.91 
 
 		 620 aa  118  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  25.38 
 
 		 648 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  25.38 
 
 		 648 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  24.29 
 
 		 562 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  26.11 
 
 		 572 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  28.03 
 
 		 561 aa  117  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  25.51 
 
 		 650 aa  117  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  26.59 
 
 		 620 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.59 
 
 		 620 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.73 
 
 		 620 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.73 
 
 		 620 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.73 
 
 		 620 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.59 
 
 		 620 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1341  potassium efflux system protein  25.15 
 
 		 589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  26.73 
 
 		 620 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.73 
 
 		 620 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.81 
 
 		 543 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.91 
 
 		 620 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  24.96 
 
 		 606 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  25.14 
 
 		 649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  25.67 
 
 		 617 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  23.86 
 
 		 563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.54 
 
 		 620 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1166  potassium efflux system protein  24.2 
 
 		 585 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0907  sodium/hydrogen exchanger  24.34 
 
 		 563 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.116888  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  24.78 
 
 		 606 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3068  potassium efflux system protein  24.95 
 
 		 631 aa  114  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  23.48 
 
 		 673 aa  114  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  24.17 
 
 		 648 aa  114  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  25.14 
 
 		 628 aa  113  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1020  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  24.86 
 
 		 589 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  24.17 
 
 		 592 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.278233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>