175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2164 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  412  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  77 
 
 
200 aa  308  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  49 
 
 
206 aa  200  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  42.71 
 
 
200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.29 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.76 
 
 
294 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  36.27 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.21 
 
 
295 aa  124  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  35.32 
 
 
202 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  36.5 
 
 
196 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  36.05 
 
 
292 aa  123  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  34.33 
 
 
202 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.8 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  35.6 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  35.03 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  36.13 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  36.04 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  29.65 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  29.65 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.58 
 
 
294 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  36 
 
 
291 aa  115  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  34.83 
 
 
203 aa  115  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  33 
 
 
203 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  29.85 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  33.84 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.45 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  32.51 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  32.51 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  32.51 
 
 
203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  32.51 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  32.02 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  33 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  32.51 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  32.02 
 
 
203 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  32.51 
 
 
203 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.47 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.51 
 
 
217 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  31.53 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  38.46 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  38.46 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2920  hypothetical protein  30.88 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  34.41 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  32.31 
 
 
203 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  38.25 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.67 
 
 
203 aa  108  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  38.25 
 
 
208 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  33.5 
 
 
206 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  38.04 
 
 
209 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  38.04 
 
 
209 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  31.98 
 
 
203 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  33.51 
 
 
211 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5124  flavin reductase-like, FMN-binding  33.99 
 
 
216 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.178532 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  36.81 
 
 
209 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02124  hypothetical protein  34.15 
 
 
169 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  37.7 
 
 
209 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  34.62 
 
 
205 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  38.25 
 
 
209 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.5 
 
 
209 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  37.82 
 
 
208 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  37.5 
 
 
209 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  37.7 
 
 
210 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.66 
 
 
206 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  33.85 
 
 
220 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  33.69 
 
 
201 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  37.82 
 
 
208 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  37.82 
 
 
221 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  37.7 
 
 
208 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  37.36 
 
 
207 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  33.85 
 
 
220 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  28.35 
 
 
203 aa  105  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  36.78 
 
 
230 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00876  conserved hypothetical protein  36.18 
 
 
313 aa  105  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.799702  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  33.15 
 
 
194 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  35.96 
 
 
205 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  42.52 
 
 
208 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  34.78 
 
 
209 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
194 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  33.7 
 
 
194 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  31.72 
 
 
201 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  30.69 
 
 
208 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  36.84 
 
 
228 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  34.3 
 
 
205 aa  101  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  36.2 
 
 
205 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  33.15 
 
 
207 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  32.09 
 
 
212 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  35 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.4 
 
 
209 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  38.25 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  42.37 
 
 
184 aa  99.4  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  31.05 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  31.58 
 
 
201 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.81 
 
 
223 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  33.73 
 
 
210 aa  99.4  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  31.38 
 
 
202 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  34.48 
 
 
206 aa  99  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  31.75 
 
 
230 aa  99  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  31.75 
 
 
230 aa  99  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>