104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2081 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2081  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  918    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2554  citrate transporter  54.67 
 
 		 457 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000334363  hitchhiker  1.3683e-16 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4048  citrate transporter  41.4 
 
 		 461 aa  279  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3347  citrate transporter  39.53 
 
 		 462 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916908  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0416  citrate transporter  37.45 
 
 		 464 aa  269  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00414278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1595  GntP family transporter  41.02 
 
 		 471 aa  259  6e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.845191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0768  hypothetical protein  37.39 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.402373  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0751  hypothetical protein  37.39 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683587  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1431  GntP family transporter  39.61 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.68613  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1707  citrate transporter  36.81 
 
 		 469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3078  hypothetical protein  36.67 
 
 		 463 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2980  hypothetical protein  36.11 
 
 		 466 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0594  citrate transporter  37.01 
 
 		 463 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0830  citrate transporter  35.58 
 
 		 487 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.857504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2789  Citrate transporter  35.87 
 
 		 466 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2382  Citrate transporter  36 
 
 		 466 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3074  citrate transporter  36.67 
 
 		 463 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6939  Citrate transporter  36.32 
 
 		 466 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2792  citrate transporter  36.67 
 
 		 463 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221695  normal  0.129925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13910  integral membrane permease/GntP family/citrate transporter  39.01 
 
 		 463 aa  246  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000614873  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2717  citrate transporter  36.67 
 
 		 463 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4854  citrate transporter  36.58 
 
 		 467 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5401  citrate transporter  36.58 
 
 		 467 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.487736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2650  citrate transporter  36.22 
 
 		 463 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0456  hypothetical protein  34.99 
 
 		 465 aa  243  7.999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.259355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4278  citrate transporter  36.3 
 
 		 466 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.991467  normal  0.456122 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3275  citrate transporter  35.99 
 
 		 495 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143329  normal  0.0330596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3440  Citrate transporter  32.61 
 
 		 521 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0128  H+/gluconate symporter family protein  36.24 
 
 		 467 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2892  hypothetical protein  35.71 
 
 		 467 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17600  membrane protein, D-beta-hydroxybutyrate permease  35.43 
 
 		 463 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0362  hypothetical protein  35.71 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1244  YxjC protein  35.71 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460946  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5331  citrate transporter  36.44 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1768  citrate transporter  35.61 
 
 		 481 aa  238  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5530  citrate transporter  36.44 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1545  hypothetical protein  35.71 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0375228  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1734  hypothetical protein  35.71 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0301594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3009  hypothetical protein  35.71 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000107347  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0395  hypothetical protein  35.71 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202442  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4742  citrate transporter  36.44 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3728  hypothetical protein  35.78 
 
 		 463 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38580  hypothetical protein  34.77 
 
 		 463 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2569  Citrate transporter  34.07 
 
 		 484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2065  hypothetical protein  36.62 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2221  hypothetical protein  36.62 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2211  hypothetical protein  35.5 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3285  hypothetical protein  34.56 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3955  citrate transporter  35.15 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2333  hypothetical protein  36.11 
 
 		 479 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0140317  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4323  Citrate transporter  35.15 
 
 		 463 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1268  citrate transporter  34.99 
 
 		 466 aa  233  7.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2203  hypothetical protein  35.9 
 
 		 479 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1666  citrate transporter family protein  35.41 
 
 		 463 aa  232  9e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2046  citrate transporter  35.04 
 
 		 479 aa  232  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.02921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3642  citrate transporter  35.28 
 
 		 469 aa  232  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.994424  normal  0.156784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1854  Citrate transporter  36.23 
 
 		 463 aa  232  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.761609 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2686  permease  35.85 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3481  hypothetical protein  38.93 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31169 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2249  hypothetical protein  36.11 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9907900000000003e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2005  gluconate permease  36.89 
 
 		 479 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0226101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2707  integral membrane protein; gluconate transporter  35.64 
 
 		 478 aa  230  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4691  putative permease  33.33 
 
 		 485 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00173372  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3122  hypothetical protein  35.9 
 
 		 479 aa  229  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000385329 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2004  gluconate permease  36.3 
 
 		 479 aa  229  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000311316  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2518  hypothetical protein  34.89 
 
 		 466 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.019888 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1629  citrate transporter  36.89 
 
 		 479 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0518899  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0564  citrate transporter  34.27 
 
 		 461 aa  226  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0794  citrate transporter  35.48 
 
 		 491 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22430  H+/gluconate symporter family protein  33.2 
 
 		 483 aa  225  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.399146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0547  citrate transporter  33.77 
 
 		 463 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4755  citrate transporter  34.13 
 
 		 463 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1395  citrate transporter  34.71 
 
 		 484 aa  224  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2251  hypothetical protein  35.87 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4432  Citrate transporter  34.71 
 
 		 463 aa  220  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.605428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0583  citrate transporter  35.99 
 
 		 466 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10190  H+/gluconate symporter family protein  36.11 
 
 		 469 aa  218  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.438603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01390  H+/gluconate symporter family protein  31.46 
 
 		 489 aa  210  4e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2437  citrate transporter  32.56 
 
 		 479 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568762  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2001  citrate transporter  31.14 
 
 		 465 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1979  citrate transporter  32.73 
 
 		 431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02262  GntP family permease  39.01 
 
 		 428 aa  96.7  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.470308  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3399  Citrate transporter  28.29 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0931  citrate transporter family protein  34.21 
 
 		 141 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0992  citrate transporter family protein  34.21 
 
 		 141 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1012  citrate transporter family protein  34.21 
 
 		 141 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0122891  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0963  citrate transporter family protein  34.21 
 
 		 141 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0853  putative permease protein  25 
 
 		 419 aa  53.9  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2593  gluconate permease  27.61 
 
 		 421 aa  53.5  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  25.27 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0845  GntP family permease  25 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00379452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3624  Gluconate transporter  31.85 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  24 
 
 		 462 aa  50.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4051  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  27.88 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4082  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  26.75 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.143116 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0112  gluconate transporter  27.88 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04190  fructuronate transporter  23.68 
 
 		 447 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  28.15 
 
 		 461 aa  43.5  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4547  fructuronate transporter  23.68 
 
 		 447 aa  43.5  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4919  fructuronate transporter  23.68 
 
 		 447 aa  43.5  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>