More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2078 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  100 
 
 		 576 aa  1199    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  63.59 
 
 		 597 aa  753    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  37.39 
 
 		 624 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  36.01 
 
 		 577 aa  360  5e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  33.5 
 
 		 638 aa  349  6e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  26.18 
 
 		 552 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  27.74 
 
 		 557 aa  187  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  26.4 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  28.79 
 
 		 581 aa  181  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  26.98 
 
 		 555 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  25.68 
 
 		 554 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  26.71 
 
 		 542 aa  170  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  26.73 
 
 		 585 aa  170  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  27.21 
 
 		 547 aa  165  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  24.5 
 
 		 547 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  25.9 
 
 		 547 aa  163  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  26.13 
 
 		 555 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  24.14 
 
 		 537 aa  160  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  26.02 
 
 		 545 aa  160  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  25.89 
 
 		 544 aa  153  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  24.49 
 
 		 563 aa  151  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3968  amidohydrolase 3  23.23 
 
 		 560 aa  151  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  25.98 
 
 		 586 aa  150  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  25.67 
 
 		 625 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  25.75 
 
 		 592 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  23.67 
 
 		 536 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  23.67 
 
 		 536 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  23.67 
 
 		 536 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  24.58 
 
 		 575 aa  143  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  25.17 
 
 		 601 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25 
 
 		 575 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  24.06 
 
 		 541 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  23.71 
 
 		 574 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  23.98 
 
 		 581 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  24.28 
 
 		 650 aa  136  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  24.11 
 
 		 539 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  23.16 
 
 		 584 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  23.72 
 
 		 556 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  25.72 
 
 		 556 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  23.51 
 
 		 620 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  24.57 
 
 		 587 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  24.58 
 
 		 604 aa  124  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  24.78 
 
 		 603 aa  124  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0578  amidohydrolase 3  24.18 
 
 		 545 aa  124  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  23.94 
 
 		 582 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  22.87 
 
 		 590 aa  121  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  22.46 
 
 		 560 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  22.61 
 
 		 583 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  22.61 
 
 		 583 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  22.61 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  24.14 
 
 		 548 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  22.2 
 
 		 560 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  24.02 
 
 		 543 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  23.21 
 
 		 540 aa  117  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  22.7 
 
 		 606 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  25.68 
 
 		 569 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  23.75 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  23.24 
 
 		 553 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  23.58 
 
 		 564 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  24.16 
 
 		 557 aa  111  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  22.73 
 
 		 585 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  22.42 
 
 		 576 aa  111  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  22.66 
 
 		 616 aa  110  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  22.87 
 
 		 568 aa  110  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  23.24 
 
 		 564 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  24.15 
 
 		 580 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  22 
 
 		 569 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  22.83 
 
 		 525 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.39 
 
 		 540 aa  107  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  22.71 
 
 		 580 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  23.13 
 
 		 556 aa  106  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  24.15 
 
 		 580 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  22.79 
 
 		 537 aa  104  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  23.16 
 
 		 596 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  21.73 
 
 		 542 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  23.43 
 
 		 527 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  20.87 
 
 		 548 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  22.48 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  25.39 
 
 		 576 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  21.84 
 
 		 544 aa  101  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  23.6 
 
 		 563 aa  100  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  23.55 
 
 		 533 aa  100  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  21.19 
 
 		 560 aa  100  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  22.77 
 
 		 538 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  23.69 
 
 		 563 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  23.69 
 
 		 563 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  21.55 
 
 		 558 aa  98.2  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  23.42 
 
 		 564 aa  97.4  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  22.76 
 
 		 531 aa  97.1  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  22.32 
 
 		 565 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  22.08 
 
 		 564 aa  96.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  24.22 
 
 		 537 aa  96.3  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  23.75 
 
 		 505 aa  96.3  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  22.77 
 
 		 548 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  22.77 
 
 		 548 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  22.77 
 
 		 548 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  27.94 
 
 		 601 aa  94  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  22.26 
 
 		 579 aa  93.6  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  22.67 
 
 		 522 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  28.7 
 
 		 562 aa  92.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>