More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2048 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  867    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  72.51 
 
 
435 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  72.04 
 
 
449 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  74.76 
 
 
470 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  72.32 
 
 
450 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  73.22 
 
 
448 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  71.98 
 
 
459 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  71.15 
 
 
439 aa  627  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  70.91 
 
 
439 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  71.97 
 
 
440 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  70.67 
 
 
439 aa  621  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  71.09 
 
 
446 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  71.12 
 
 
439 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6179  hypothetical protein  70.64 
 
 
450 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3466  hypothetical protein  74.64 
 
 
449 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5404  FAD dependent oxidoreductase  70.38 
 
 
441 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0828166 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  66.99 
 
 
448 aa  585  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  64.76 
 
 
423 aa  580  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  64.42 
 
 
419 aa  570  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3030  hypothetical protein  65.01 
 
 
427 aa  555  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101073  normal  0.976263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0375  flavin-containing monooxygenase FMO  63.29 
 
 
436 aa  554  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1664  FAD dependent oxidoreductase  62.59 
 
 
425 aa  547  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.896547  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  61.89 
 
 
417 aa  528  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3222  potassium transport flavoprotein  56.83 
 
 
416 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.65 
 
 
422 aa  282  9e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.78 
 
 
422 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  37.9 
 
 
422 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1998  putative potassium transport flavoprotein  37.53 
 
 
434 aa  274  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4567  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 
430 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.469601 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0841  putative potassium transport flavoprotein  38.59 
 
 
446 aa  272  6e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0741556 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
445 aa  272  9e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3472  putative potassium transport flavoprotein  36.47 
 
 
428 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47986  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.8 
 
 
427 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2709  FAD dependent oxidoreductase  37.35 
 
 
429 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4746  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.39 
 
 
428 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137781  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1414  hypothetical protein  36.61 
 
 
429 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1106  potassium transport flavoprotein  35.85 
 
 
433 aa  259  9e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.251507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.7 
 
 
399 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00083188  normal  0.623853 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.95 
 
 
435 aa  257  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2255  putative flavoprotein  36.59 
 
 
419 aa  256  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7583  flavin-containing monooxygenase  35.96 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  36.28 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2098  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 
430 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4240  putative flavoprotein  34.94 
 
 
412 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13111  hypothetical protein  34.93 
 
 
433 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0556  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 
443 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.881432  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2625  hypothetical protein  36.41 
 
 
415 aa  243  7e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623222  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1342  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.35 
 
 
466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.43 
 
 
413 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.1 
 
 
349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.86 
 
 
348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.66 
 
 
377 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.22 
 
 
378 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40.55 
 
 
361 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.06 
 
 
352 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02550  potassium transporter (Trk family)  36.7 
 
 
343 aa  143  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.68 
 
 
372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.65 
 
 
358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  35.35 
 
 
347 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  35.35 
 
 
347 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  35.35 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  35.35 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  34.47 
 
 
347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  34.88 
 
 
347 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.68 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931293  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  33.95 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  37.7 
 
 
347 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  37.3 
 
 
347 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  35.02 
 
 
371 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4111  Trk family potassium transport protein  37.04 
 
 
352 aa  106  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.16 
 
 
369 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3468  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.44 
 
 
381 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.44 
 
 
348 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.2 
 
 
399 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  28.19 
 
 
364 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.54 
 
 
375 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.34 
 
 
362 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.9 
 
 
362 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  37.1 
 
 
407 aa  93.6  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  33.84 
 
 
360 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  32.8 
 
 
640 aa  92.4  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  32.23 
 
 
363 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  31.44 
 
 
573 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.5 
 
 
427 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  33.16 
 
 
378 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.52 
 
 
358 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18210  Predicted flavoprotein involved in K+ transport  36.65 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08351  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  30.5 
 
 
614 aa  84  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.82 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4391  putative potassium transport flavoprotein  30.05 
 
 
598 aa  83.2  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00850  flavin-containing monooxygenase, putative  32.12 
 
 
637 aa  81.6  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.13103  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03590  monooxygenase protein, putative  29.23 
 
 
648 aa  80.9  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4752  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  31.09 
 
 
601 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2881  flavin-containing monooxygenase FMO  27.45 
 
 
609 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26460  predicted flavoprotein involved in K+ transport  31.19 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2143  hypothetical protein  28.96 
 
 
607 aa  79.7  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.941743  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.88 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.4 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.88 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>