129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2028 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  62.07 
 
 		 231 aa  297  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  44.26 
 
 		 240 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  44.26 
 
 		 240 aa  177  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  44.26 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  44.26 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  43.83 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  44.26 
 
 		 240 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  43.4 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  43.83 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  42.98 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  44.21 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  39.74 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  40.59 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  42.08 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  40.83 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  37.93 
 
 		 221 aa  134  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  36.29 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  36.45 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  38.12 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  36.45 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  37.44 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  34.5 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  35.92 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  35.96 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  33.08 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  32.34 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  31.71 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  36.95 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  36.95 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  36.95 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  33 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  36.45 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  35 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  30.38 
 
 		 259 aa  98.6  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  33.94 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  30.83 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  37.63 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  32.02 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  36.78 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  32.52 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  32.7 
 
 		 252 aa  92.4  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  42.45 
 
 		 267 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  30.58 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  29.82 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  30.65 
 
 		 234 aa  85.1  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  31.88 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  31.3 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  28.4 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  31.09 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  31.51 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  31.09 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  31.09 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  29.63 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  29.63 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  27.63 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  30.96 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  40.52 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  30.04 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  32.09 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  25.34 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  30.87 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  32.13 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  38.68 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  32.07 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  25.33 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  35.59 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  32.64 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  27.56 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  25.85 
 
 		 287 aa  68.6  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1829  hypothetical protein  28.1 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  35.96 
 
 		 268 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  29.18 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  27.94 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  36.7 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  25.43 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  29.38 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  34.83 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4694  hypothetical protein  28.24 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3838  hypothetical protein  28.4 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3931  hypothetical protein  28.4 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0030  hypothetical protein  28.19 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00621032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  27.02 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  28 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4047  hypothetical protein  28 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  27.93 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1989  hypothetical protein  27.92 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  30.43 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2615  hypothetical protein  26.98 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.360147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  30.4 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0151  hypothetical protein  27.27 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3778  hypothetical protein  35.29 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1600  hypothetical protein  28.71 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.400677  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  29.86 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0546  hypothetical protein  29.37 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0802876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0128  hypothetical protein  28.25 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4213  hypothetical protein  28.25 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0231  histidine kinase  31.86 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0721367  normal  0.567279 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>