More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2004 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  100 
 
 
456 aa  929    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  50.89 
 
 
450 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  50.44 
 
 
449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  50.67 
 
 
451 aa  449  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  50.67 
 
 
450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  49.56 
 
 
454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  49.66 
 
 
458 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  49.33 
 
 
458 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  50.11 
 
 
455 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  52.31 
 
 
450 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  49.02 
 
 
455 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  48.34 
 
 
449 aa  433  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  52.55 
 
 
451 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0735  aspartate kinase III  53.04 
 
 
456 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000266355  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  52.11 
 
 
451 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  49.12 
 
 
461 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  52.55 
 
 
451 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  52.77 
 
 
451 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  52.55 
 
 
451 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  52.77 
 
 
451 aa  431  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  51.88 
 
 
452 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  49.34 
 
 
461 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  52.11 
 
 
451 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  52.11 
 
 
451 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  49.12 
 
 
461 aa  430  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  50 
 
 
449 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  50 
 
 
449 aa  425  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  50.22 
 
 
449 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  52.11 
 
 
451 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  50 
 
 
449 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  50 
 
 
449 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  50.22 
 
 
449 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  50.22 
 
 
449 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  50 
 
 
449 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4006  aspartate kinase III  50 
 
 
449 aa  423  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.193511 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  50.22 
 
 
449 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  50.22 
 
 
449 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  50.22 
 
 
449 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  50.22 
 
 
449 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  50.11 
 
 
449 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  50.22 
 
 
449 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  52.2 
 
 
452 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  50.87 
 
 
459 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3425  aspartate kinase III  48.22 
 
 
452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000055532  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3764  aspartate kinase III  51.1 
 
 
450 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226925  hitchhiker  0.00174261 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  36.42 
 
 
471 aa  286  4e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  36.64 
 
 
471 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  35.48 
 
 
471 aa  277  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  35.21 
 
 
471 aa  277  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  35.93 
 
 
471 aa  277  4e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  34.13 
 
 
471 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  36.38 
 
 
469 aa  269  8.999999999999999e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  34.99 
 
 
471 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  34.42 
 
 
456 aa  246  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.39 
 
 
815 aa  236  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  33.69 
 
 
818 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25490  aspartate kinase  36.36 
 
 
450 aa  230  4e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6874  aspartate kinase  32.89 
 
 
440 aa  230  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.52096 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3721  aspartate kinase  33.33 
 
 
444 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14309  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  32.18 
 
 
541 aa  227  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5632  aspartate kinase  31.06 
 
 
441 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000704481  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  32.12 
 
 
814 aa  225  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  31.47 
 
 
478 aa  223  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  31.96 
 
 
878 aa  223  7e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  33.11 
 
 
437 aa  220  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.75 
 
 
817 aa  219  7.999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3817  aspartate kinase  31.74 
 
 
452 aa  216  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00114248  normal  0.367639 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  31.69 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  30 
 
 
446 aa  210  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.02 
 
 
815 aa  209  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  30.74 
 
 
467 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  29.85 
 
 
823 aa  207  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  30.69 
 
 
468 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  31.57 
 
 
462 aa  204  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  30.7 
 
 
859 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  30.52 
 
 
465 aa  204  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  30.7 
 
 
859 aa  203  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  30.77 
 
 
468 aa  203  6e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  30.56 
 
 
468 aa  203  7e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  32.17 
 
 
462 aa  202  7e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  33.11 
 
 
467 aa  202  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.55 
 
 
823 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0142  aspartate kinase  30.04 
 
 
463 aa  197  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0843  aspartate kinase  30.75 
 
 
468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.97 
 
 
819 aa  196  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2330  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.16 
 
 
822 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0683  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.19 
 
 
819 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000368651  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.97 
 
 
819 aa  194  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  28.76 
 
 
465 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2189  aspartate kinase  28.54 
 
 
446 aa  194  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  31.03 
 
 
815 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  30.69 
 
 
472 aa  193  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1175  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.69 
 
 
821 aa  193  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  29.13 
 
 
857 aa  193  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0808  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.68 
 
 
819 aa  193  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3604  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.68 
 
 
819 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.331342  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3476  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.68 
 
 
819 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3863  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.89 
 
 
819 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3668  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.68 
 
 
819 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  29.49 
 
 
465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>