More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1977 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 769 aa  1569    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  47.81 
 
 		 757 aa  698    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  46.53 
 
 		 731 aa  623  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  46.22 
 
 		 754 aa  599  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  43.35 
 
 		 758 aa  593  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  42.98 
 
 		 777 aa  589  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  44.05 
 
 		 738 aa  567  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1679  TonB-dependent receptor  43.78 
 
 		 742 aa  552  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0383405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  39.79 
 
 		 761 aa  491  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  39.38 
 
 		 763 aa  472  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  39.57 
 
 		 776 aa  464  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 747 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 773 aa  232  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 771 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 773 aa  228  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 794 aa  217  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 737 aa  215  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 763 aa  210  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 743 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 758 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 783 aa  195  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 764 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 761 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 782 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 759 aa  190  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 729 aa  189  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 762 aa  187  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 790 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 857 aa  184  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 764 aa  184  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 704 aa  184  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 771 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  25.54 
 
 		 741 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.68 
 
 		 755 aa  180  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 731 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 758 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 803 aa  178  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  26.3 
 
 		 759 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 771 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 726 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 777 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 725 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 745 aa  174  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 808 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 780 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 780 aa  172  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 765 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 761 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 723 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 761 aa  169  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 774 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 732 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 726 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 728 aa  168  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 779 aa  168  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 778 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 750 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 741 aa  165  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 770 aa  165  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 798 aa  164  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 759 aa  164  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.58 
 
 		 767 aa  164  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 713 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  25.5 
 
 		 829 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 773 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 728 aa  163  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 765 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 783 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  25.03 
 
 		 799 aa  162  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 790 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 738 aa  161  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 732 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 743 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 759 aa  160  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 767 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 822 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 756 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 800 aa  158  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 800 aa  158  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 755 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 862 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  26.47 
 
 		 751 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 703 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 792 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  25.7 
 
 		 754 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 702 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 755 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 791 aa  154  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 785 aa  154  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 766 aa  154  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 710 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 748 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  25.12 
 
 		 747 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 786 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  24.88 
 
 		 809 aa  152  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 790 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 797 aa  151  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 771 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 778 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 769 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>