160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1941 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1941  cytochrome b561 family protein  100 
 
 		 239 aa  488  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00760577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2726  cytochrome b, putative  41.03 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2214  cytochrome B561  38.79 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312058  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2317  cytochrome B561  38.84 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0816161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2387  cytochrome B561  38.84 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.549561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2692  cytochrome B561  40 
 
 		 261 aa  162  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000585757  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1831  cytochrome B561  39.74 
 
 		 248 aa  161  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2491  cytochrome B561  40.17 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1795  cytochrome B561  40.17 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1787  cytochrome B561  40.17 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2388  cytochrome b561  40.72 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2510  cytochrome B561  38.84 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  hitchhiker  0.00000518904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2729  cytochrome B561  37.23 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3441  hypothetical protein  66.67 
 
 		 101 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  29.36 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2321  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.82 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3146  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.4 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0114554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1448  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  24.8 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0615119  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  27.5 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0855  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.19 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.34705 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3330  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.41 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3369  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.4 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00901378  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  33.57 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0121  nickel-iron hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.73 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.347229  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2054  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.18 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  25.53 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0857  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.5 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0113  cytochrome B561  25.1 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  25.11 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  28.67 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0874  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.08 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2175  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.05 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000847396  normal  0.136379 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  24.89 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1860  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.49 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  24.89 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1163  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  23.79 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2058  cytochrome B561  23.93 
 
 		 251 aa  62  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0173  cytochrome B561  23.93 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.551563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  24.05 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  24.67 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0543  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.21 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1591  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.35 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  27.27 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  24.68 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  27.59 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2429  [Ni/Fe] hydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  23.08 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943103  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1641  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  24.6 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  22.75 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1799  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  24.6 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1649  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  24.6 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49100  Nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.88 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1634  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  24.6 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  26.07 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1061  cytochrome B561  24.57 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4949  cytochrome B561  28.12 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  30.6 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1708  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  24.6 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.33968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0974  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.58 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000584739  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  27.59 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  27.59 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  27.59 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2916  cytochrome B561  21.85 
 
 		 390 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.494489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3405  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.13 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.788903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  27.59 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7263  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  21.61 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73881  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  21.68 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0835  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.28 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  24.55 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50570  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit, HoxZ  23.27 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00896899  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  23.93 
 
 		 387 aa  55.1  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2027  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.44 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  25.73 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1972  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.98 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.184335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  22.77 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  22.77 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1367  cytochrome B561  21.01 
 
 		 390 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2545  cytochrome B561  26.54 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0290  cytochrome B561  26.75 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000341868 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0285  cytochrome B561  26.75 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0260456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  21.93 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  25.93 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  24.78 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  25.93 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3908  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  21.29 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1998  Ni/Fe-hydrogenase, 1 b-type cytochrome subunit  22.76 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3100  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.83 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  25.86 
 
 		 365 aa  52.8  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2042  cytochrome B561  28.76 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0005809  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  24.68 
 
 		 387 aa  52.4  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  23.93 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2739  cytochrome B561  28.17 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00196146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  28.24 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3987  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  21.28 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0336  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  20.99 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00129504  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  24.26 
 
 		 230 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  24.78 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1152  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.11 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.955059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  22.32 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  23.93 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  25.38 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>