More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1918 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  100 
 
 
204 aa  411  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  58.15 
 
 
212 aa  209  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  51.15 
 
 
174 aa  175  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  43.62 
 
 
201 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  47.83 
 
 
190 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  43.92 
 
 
197 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  46.86 
 
 
175 aa  141  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  44.5 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  42.25 
 
 
204 aa  138  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  37.89 
 
 
193 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  37.89 
 
 
193 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  37.89 
 
 
193 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  37.5 
 
 
200 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  34.92 
 
 
203 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  35.79 
 
 
193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  33.7 
 
 
205 aa  126  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  37.22 
 
 
209 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  34.87 
 
 
243 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  37.22 
 
 
209 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  37.22 
 
 
209 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  37.22 
 
 
209 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  36.67 
 
 
209 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  36.67 
 
 
209 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  33.17 
 
 
202 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  34.5 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  34.07 
 
 
194 aa  118  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  36.41 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  30.6 
 
 
198 aa  111  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  29.79 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  29.79 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  29.79 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  33.49 
 
 
209 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  32.14 
 
 
197 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  33.49 
 
 
209 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  32.45 
 
 
184 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  33.49 
 
 
209 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  33.68 
 
 
187 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  32.83 
 
 
226 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  30.05 
 
 
235 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  30.05 
 
 
234 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  30.05 
 
 
234 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  34.81 
 
 
184 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  34.41 
 
 
234 aa  98.2  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  34.38 
 
 
196 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  27.62 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  38.12 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  32.7 
 
 
211 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  27.72 
 
 
199 aa  94.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  31.16 
 
 
189 aa  94.4  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  27.72 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  27.54 
 
 
262 aa  93.2  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  27.62 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  30.69 
 
 
199 aa  91.7  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  34.5 
 
 
199 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  32.49 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  30.05 
 
 
183 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  32.83 
 
 
200 aa  88.2  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  32.72 
 
 
296 aa  88.2  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  29.23 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  30.65 
 
 
234 aa  86.7  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  32.18 
 
 
199 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  30.17 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  27.75 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  27.27 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  29.84 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  33.51 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2480  cytochrome c oxidase, subunit III  33.14 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  31.46 
 
 
202 aa  82  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  34.63 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  32.4 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  27.17 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  32.1 
 
 
295 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  31.43 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  35 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  30.46 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  31.48 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  33.82 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  26.88 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  36.92 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  26.59 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  26.59 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  26.59 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  28.32 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  31.68 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  25.75 
 
 
259 aa  79  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  32.24 
 
 
819 aa  79  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  29.31 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  27.17 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  29.11 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  31.54 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  26.01 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  26.01 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  26.01 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  27.44 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  29.71 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  27.13 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  30.88 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  29.06 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  36.3 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  33.08 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>