More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1750 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  51.29 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  48.7 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0281  two component transcriptional regulator  51.74 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000215794  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3570  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000660562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  49.78 
 
 		 228 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0279  two component transcriptional regulator  50.87 
 
 		 227 aa  208  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000622263  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  47.84 
 
 		 226 aa  208  7e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3461  response regulator receiver  49.34 
 
 		 226 aa  208  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3933  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956729  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00535  Transcriptional regulatory protein CpxR  45.8 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  47.41 
 
 		 226 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  48.05 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  46.96 
 
 		 238 aa  205  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 232 aa  204  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  48.5 
 
 		 228 aa  204  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.85 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.85 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  47.83 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6145  two component response regulator  45.22 
 
 		 229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  45.22 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4132  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.98 
 
 		 232 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000494358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0081  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.98 
 
 		 232 aa  192  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0084  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.98 
 
 		 232 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.601085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 235 aa  191  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3275  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 232 aa  185  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000116561  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 223 aa  185  7e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4562  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488322  normal  0.0982939 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4457  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.98 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4390  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.98 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4276  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.98 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7488  two component response regulator  42.42 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4346  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.98 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  0.0000000817459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.98 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1624  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.32 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3850  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.85 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 222 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03798  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CpxA  44.98 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4072  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.476785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.98 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0517203  normal  0.0145886 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4392  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.98 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4446  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.98 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03747  hypothetical protein  44.98 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0830559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5367  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.98 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4105  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.98 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.393063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4143  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.98 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4033  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  42.79 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4810  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  43.23 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  39.42 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2572  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186253 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3411  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 229 aa  178  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2797  transcriptional regulator, CpxR  46.52 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000288823  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3195  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 226 aa  177  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0261  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000347248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0254  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000326652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3846  two component transcriptional regulator  40.6 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.225052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  40.66 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2970  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 230 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.068725 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0256  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000272342  decreased coverage  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0261  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000361731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4060  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  43.67 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0704  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.09 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3372  winged helix family two component transcriptional regulator  40.61 
 
 		 233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690812  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3452  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6517  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0325894 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4477  transcriptional regulatory protein CpxR  48.03 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0252  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000571082  hitchhiker  0.000346333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3769  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000556998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0253  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000454029  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0367  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000100212  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3185  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.729743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2386  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.3038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1223  two component transcriptional regulator  43.35 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06763  transcriptional regulatory protein CpxR  41.38 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0151  two component transcriptional regulator  38.59 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.68 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1424  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00122466  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2753  transcriptional regulatory protein CpxR  39.65 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1313  transcriptional regulatory protein CpxR  39.21 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.186950000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2416  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134995  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_003296  RS03088  two-component response regulator transcription regulator protein  39.3 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31150  Response regulator  40.69 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000851  probable transcriptional regulator SyrB  40.69 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00675785  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2046  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.3 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.095715  hitchhiker  0.000000000691151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2301  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  40.76 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1213  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2050  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00938  transcriptional regulatory protein CpxR  39.17 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000268904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>