184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1745 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  100 
 
 
131 aa  263  8e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  37.4 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 
559 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.02 
 
 
579 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.5 
 
 
689 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.23 
 
 
722 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  34.38 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  32.54 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  34.38 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  33.85 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  36 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  31.71 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.87 
 
 
518 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  32.8 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  33.88 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  34.88 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  32.26 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  36 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  35.54 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  34.92 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  31.2 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2484  hemerythrin-like metal-binding protein  36.92 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0423908  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  34.92 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  32.54 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.48 
 
 
963 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.04 
 
 
997 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.03 
 
 
927 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 
518 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 
518 aa  72  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.8 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.5 
 
 
926 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  31.54 
 
 
615 aa  71.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.16 
 
 
515 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 
526 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  32.26 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 
529 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.16 
 
 
515 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  32.8 
 
 
135 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  30.83 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  34.38 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.58 
 
 
529 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.75 
 
 
529 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.75 
 
 
529 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.75 
 
 
529 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.75 
 
 
529 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0465  hemerythrin-like metal-binding protein  31.15 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0529238  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  30.58 
 
 
529 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  30.71 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  30.33 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  30.4 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  28.57 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  30.83 
 
 
596 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  31.71 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1895  hemerythrin-like metal-binding protein  34.51 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.689554  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.83 
 
 
779 aa  68.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  32.31 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.58 
 
 
529 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0987  hemerythrin-like metal-binding protein  29.37 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  31.25 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  30.95 
 
 
161 aa  67  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  30.09 
 
 
183 aa  67  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  34.43 
 
 
722 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  29.63 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  30.95 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 
994 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.15 
 
 
963 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  33.61 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  29.69 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28 
 
 
1032 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  30.95 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 
736 aa  65.5  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  30.16 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0327  hemerythrin-like metal-binding protein  29.84 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  30.33 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  31.2 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  30.89 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  30.08 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  29.37 
 
 
871 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1401  hemerythrin-like metal-binding protein  31.01 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  28.81 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  28.8 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  28.68 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3696  hemerythrin HHE cation binding region  29.66 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  28.35 
 
 
131 aa  63.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0253  hemerythrin  33.87 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882581  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.8 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  28.8 
 
 
133 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3118  hemerythrin-like metal-binding protein  35.71 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  27.2 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  34.75 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  30.47 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  34.96 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  30.43 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  28.12 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  26.4 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  30.43 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0967  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.13 
 
 
1004 aa  61.2  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4102  hemerythrin-like metal-binding protein  42.5 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.43 
 
 
133 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>