More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1708 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  100 
 
 
817 aa  1670    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  37 
 
 
843 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  35.8 
 
 
847 aa  487  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  36.22 
 
 
817 aa  474  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  36.9 
 
 
797 aa  464  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 
803 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  36.53 
 
 
853 aa  452  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 
797 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  34.99 
 
 
948 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  35.02 
 
 
797 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 
812 aa  452  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 
812 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 
797 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 
812 aa  452  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  34.9 
 
 
848 aa  451  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  35.05 
 
 
797 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  36.76 
 
 
800 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  35.2 
 
 
853 aa  439  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.16 
 
 
800 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  36.62 
 
 
870 aa  430  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 
918 aa  432  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  35.59 
 
 
803 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  35.53 
 
 
788 aa  423  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  34.38 
 
 
874 aa  424  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  35.41 
 
 
788 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  34.12 
 
 
795 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  34.86 
 
 
795 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  34.42 
 
 
784 aa  412  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  34.2 
 
 
924 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  33.76 
 
 
840 aa  395  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 
933 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 
887 aa  388  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 
851 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 
877 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 
857 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  33.45 
 
 
795 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 
868 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 
869 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  32.47 
 
 
864 aa  373  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 
793 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 
800 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 
811 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  34.09 
 
 
799 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.48 
 
 
856 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  32.29 
 
 
1015 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  32.54 
 
 
793 aa  372  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  32.67 
 
 
867 aa  365  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 
924 aa  362  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  31 
 
 
867 aa  360  7e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.06 
 
 
811 aa  357  3.9999999999999996e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 
870 aa  355  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  33.37 
 
 
811 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  30.69 
 
 
961 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  32.36 
 
 
823 aa  344  4e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 
987 aa  344  4e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  31.08 
 
 
821 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  32.48 
 
 
884 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 
871 aa  335  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 
835 aa  335  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 
850 aa  331  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  30.48 
 
 
815 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 
815 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 
947 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 
842 aa  328  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 
872 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 
804 aa  325  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  31.51 
 
 
883 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 
833 aa  303  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.83 
 
 
832 aa  300  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 
818 aa  298  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 
847 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 
858 aa  270  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  31.48 
 
 
948 aa  259  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 
849 aa  248  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 
816 aa  243  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 
873 aa  233  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 
842 aa  223  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 
885 aa  222  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 
852 aa  221  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 
813 aa  208  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 
858 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 
867 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 
861 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 
879 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 
841 aa  159  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 
817 aa  150  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 
838 aa  142  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 
843 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  23.51 
 
 
880 aa  132  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  38.29 
 
 
869 aa  127  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  37.33 
 
 
873 aa  125  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  36.89 
 
 
873 aa  124  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  37.28 
 
 
836 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  38.79 
 
 
910 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 
853 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 
853 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 
904 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 
853 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 
904 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  39.15 
 
 
861 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>