193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1677 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 299 aa  619  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  28.15 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  28.76 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  25.42 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  23.21 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  27.35 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  25.33 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  23.01 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  22.76 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  24.28 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  26.6 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  25.48 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  23.25 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  25.34 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  23.9 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  21.68 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  24.88 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  27.35 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  26.9 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  20.88 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  23.67 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  24.91 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  22.03 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  22.63 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  24.62 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  24.62 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  24.74 
 
 		 444 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  26.7 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  27.13 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  22.96 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  24.43 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  24.4 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  22.73 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  22.96 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  23.47 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  22.96 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  25.65 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  25.65 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  25.65 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  25.65 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  25.65 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  24.58 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  25.65 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  25.82 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  26.6 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  25.65 
 
 		 486 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  24.02 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  22.43 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  25 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  26.5 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  24.23 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  22.1 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  23.77 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  22.07 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  22.93 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  25.11 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.42 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  22.35 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  23.29 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  23.73 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  24.88 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  22.32 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  25.79 
 
 		 207 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  23.73 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 		 311 aa  53.1  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 		 425 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  24.68 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  25.74 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  21.6 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  24.27 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  23.48 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  26.28 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  22.76 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  23.28 
 
 		 655 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  21.9 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 		 238 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  23.32 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3261  Beta-lactamase  24.76 
 
 		 249 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1076  metallo-beta-lactamase family protein  27.08 
 
 		 196 aa  49.7  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.253465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>