More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1656 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1793  acetyl-CoA hydrolase/transferase  55.39 
 
 
614 aa  684    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00194756  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1656  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase, putative/acetyltransferase, GNAT family protein  100 
 
 
622 aa  1291    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00185  fused 4-Hydroxybutyrate CoA-transferase/acetyltransferase domain of GNAT  58.97 
 
 
615 aa  770    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1748  acetyl-CoA hydrolase/transferase  65.94 
 
 
611 aa  835    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1430  acetyl-CoA hydrolase/transferase  44.44 
 
 
616 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2824  acetyl-CoA hydrolase/transferase  44.41 
 
 
616 aa  498  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2142  GCN5-related N-acetyltransferase:Acetyl-CoA hydrolase/transferase  44.09 
 
 
617 aa  490  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3070  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.55 
 
 
645 aa  478  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155657 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1278  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.35 
 
 
634 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863753  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1193  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.91 
 
 
623 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000807125  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2104  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  49.88 
 
 
432 aa  436  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0060  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  50.73 
 
 
430 aa  437  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0404661  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2889  acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.98 
 
 
430 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000123716  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2497  acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.24 
 
 
427 aa  438  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.242063  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0619  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.24 
 
 
627 aa  436  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2254  acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.87 
 
 
428 aa  430  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2715  acetyl-CoA hydrolase/transferase  49.04 
 
 
429 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1010  acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.85 
 
 
424 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763151 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2513  acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.25 
 
 
430 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0317951  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1613  acetyl-CoA hydrolase/transferase  51.24 
 
 
455 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.925484 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0965  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  51.09 
 
 
424 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1257  acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.25 
 
 
453 aa  418  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1027  acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.85 
 
 
424 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1024  acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.85 
 
 
424 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3773  acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.73 
 
 
431 aa  415  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0911  acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.86 
 
 
431 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0086  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.65 
 
 
636 aa  409  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0809  acetyl-CoA hydrolase/transferase  51.86 
 
 
428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0950  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.74 
 
 
443 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540968  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1894  acetyl-CoA hydrolase/transferase  49.75 
 
 
428 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4998  acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.12 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0205642 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0746  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.33 
 
 
634 aa  395  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0690  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  46.47 
 
 
431 aa  392  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000582871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.65 
 
 
445 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0057  acetyl-CoA hydrolase/transferase  47.26 
 
 
420 aa  388  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1418  acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.65 
 
 
445 aa  389  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  47.29 
 
 
428 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1976  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.11 
 
 
633 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3493  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.19 
 
 
428 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.786006 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1708  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  46.55 
 
 
428 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1423  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.43 
 
 
428 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2399  acetyl-CoA hydrolase/transferase  44.69 
 
 
428 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2747  acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.19 
 
 
428 aa  372  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2898  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  44.06 
 
 
428 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.669885  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2572  acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.19 
 
 
449 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2639  acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.19 
 
 
449 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2830  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.81 
 
 
428 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.672634  normal  0.961785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1526  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.19 
 
 
428 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1517  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.43 
 
 
428 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1552  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.19 
 
 
428 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1956  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  43.93 
 
 
431 aa  362  1e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0603  acetyl-CoA hydrolase/transferase  43.49 
 
 
434 aa  352  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19050  acetyl-CoA hydrolase/transferase  44.55 
 
 
428 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3573  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.42 
 
 
437 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0018283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1439  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.93 
 
 
437 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3745  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.71 
 
 
432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2815  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.69 
 
 
437 aa  328  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2054  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.29 
 
 
441 aa  323  7e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0198226  hitchhiker  0.00000220967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0283  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.73 
 
 
431 aa  322  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.230364  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3304  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.05 
 
 
437 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3294  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.39 
 
 
437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0716  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.37 
 
 
431 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0053  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.18 
 
 
431 aa  300  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0701  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.19 
 
 
443 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2220  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  42.19 
 
 
443 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1315  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.81 
 
 
441 aa  296  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2303  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  41.92 
 
 
443 aa  296  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1735  acetyl-CoA hydrolase  40.05 
 
 
431 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000187656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1561  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.48 
 
 
437 aa  295  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211696  normal  0.891622 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1651  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  41.64 
 
 
443 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1727  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  41.64 
 
 
443 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1934  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  41.64 
 
 
443 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.861274  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0610  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  41.64 
 
 
445 aa  294  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2743  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.24 
 
 
432 aa  290  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3253  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.83 
 
 
407 aa  283  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2513  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  43.94 
 
 
479 aa  280  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1579  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.04 
 
 
433 aa  270  5.9999999999999995e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3916  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.65 
 
 
442 aa  269  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1744  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.17 
 
 
444 aa  264  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2158  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  37.18 
 
 
440 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2116  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.94 
 
 
440 aa  261  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.449601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2268  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.94 
 
 
440 aa  260  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0532  acetyl-CoA hydrolase  43.46 
 
 
432 aa  258  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000818274  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0516  acetyl-CoA hydrolase  45.76 
 
 
438 aa  258  3e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2447  putative acetyl-CoA hydrolase  37.96 
 
 
445 aa  254  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1785  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.71 
 
 
446 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3293  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.76 
 
 
441 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3360  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.76 
 
 
441 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3462  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.76 
 
 
441 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.366103  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2858  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.33 
 
 
446 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3367  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.76 
 
 
441 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.729069 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7279  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.75 
 
 
430 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4529  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.25 
 
 
446 aa  246  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1147  hypothetical protein  36.18 
 
 
449 aa  240  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0309  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.08 
 
 
447 aa  237  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2137  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.89 
 
 
445 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.758838  normal  0.0258609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0352  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.42 
 
 
447 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0787  hypothetical protein  35.08 
 
 
447 aa  236  9e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6899  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.22 
 
 
423 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2025  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.62 
 
 
449 aa  233  6e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000691604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>