41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1630 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1630  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  650    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2176  hypothetical protein  29.25 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.476118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  23.83 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  25.46 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  24.5 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  24.28 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  22.93 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  28.37 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  28.37 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  28.37 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  26.24 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  24.57 
 
 		 546 aa  59.3  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  23.43 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  26.13 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  26.13 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  26.13 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  26.13 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  22.41 
 
 		 552 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  22.51 
 
 		 551 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  22.51 
 
 		 551 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  26.74 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0029  transposition helper protein  25.76 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  24.68 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  22.55 
 
 		 562 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6941  hypothetical protein  22.15 
 
 		 470 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0945854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  21.34 
 
 		 551 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  22.03 
 
 		 545 aa  45.8  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  25.5 
 
 		 550 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  20.51 
 
 		 467 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  28.08 
 
 		 559 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  28.22 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  27.01 
 
 		 530 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  22.56 
 
 		 551 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  26.76 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  25 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06977  hypothetical protein  24 
 
 		 196 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  24.58 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.66 
 
 		 577 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.66 
 
 		 580 aa  43.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  23.95 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  25.11 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>