122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1562 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1562  OmpH family outer membrane protein  100 
 
 
172 aa  337  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  41.76 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1258  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  43.02 
 
 
171 aa  130  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.94 
 
 
165 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.7 
 
 
168 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.35 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.35 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.35 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1279  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.65 
 
 
165 aa  117  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000429908  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1563  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.65 
 
 
165 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000425102  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1638  outer membrane protein OmpH  41.38 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  39.87 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2632  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  41.38 
 
 
165 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2699  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  41.38 
 
 
165 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000309047  hitchhiker  0.00333472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2806  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  41.38 
 
 
165 aa  111  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000137224  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.56 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  37.79 
 
 
168 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000604382  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1842  outer membrane protein OmpH  34.52 
 
 
169 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00348927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  36.94 
 
 
165 aa  104  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  36.09 
 
 
171 aa  104  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.91 
 
 
164 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002755  outer membrane chaperone Skp (OmpH) precursor  34.12 
 
 
169 aa  92  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  32.24 
 
 
165 aa  88.2  5e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  34.39 
 
 
165 aa  87.8  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03228  hypothetical protein  32.28 
 
 
166 aa  87.8  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2967  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.64 
 
 
170 aa  85.9  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.939427  normal  0.289934 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  33.33 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  33.33 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  33.33 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.14 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  29.73 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0716  periplasmic chaperone  30.57 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000710981  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3351  periplasmic chaperone  33.33 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00292396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.29 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0950  periplasmic chaperone  32.64 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  28.95 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  28.95 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.38 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.29 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0266  periplasmic chaperone  31.21 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000300705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0247  periplasmic chaperone  31.21 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103395  normal  0.490215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0247  periplasmic chaperone  31.21 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.414945 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0263  periplasmic chaperone  31.21 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.4974 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0251  periplasmic chaperone  31.21 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.963542  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2539  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  30.41 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31836 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00176  periplasmic chaperone  30.87 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000232591  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3425  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.87 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000142566  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0188  periplasmic chaperone  30.87 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000198336  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00175  hypothetical protein  30.87 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000443159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0180  periplasmic chaperone  30.87 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.80617e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0182  periplasmic chaperone  30.87 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000231614  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3482  periplasmic chaperone  30.87 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000160675  normal  0.0663519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0189  periplasmic chaperone  30.87 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000067294  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0171  periplasmic chaperone  30.87 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000364139  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.18 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.74 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.24 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.3 
 
 
178 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17170  hypothetical protein  28.75 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38900  Outer membrane chaperone Skp  28.82 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1492  hypothetical protein  28.12 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0624  outer membrane protein  27.16 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000291301  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0725  putative outer membrane chaperone protein Skp  27.16 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0666  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.01 
 
 
175 aa  58.2  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3044  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.61 
 
 
167 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.556672  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2446  outer membrane protein OmpH, putative  27.61 
 
 
168 aa  57.4  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0885473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1352  Outer membrane protein (OmpH-like)  29.75 
 
 
159 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1543  outer membrane protein OmpH, putative  29.75 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.767097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0817  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.54 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242751  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.14 
 
 
187 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 
168 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1110  Outer membrane chaperone Skp  28.22 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.555167  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0060  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.73 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.81 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.82 
 
 
177 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.82 
 
 
167 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.82 
 
 
177 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.82 
 
 
177 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  24.82 
 
 
168 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  24.82 
 
 
168 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.82 
 
 
168 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.82 
 
 
177 aa  51.6  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.83 
 
 
168 aa  51.2  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.4 
 
 
175 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.21 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.21 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.36 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  23.4 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  24.09 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.09 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.09 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  24.82 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.21 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.38 
 
 
183 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.36 
 
 
175 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.03 
 
 
169 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4073  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.85 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.38 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>