19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1538 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1538  hypothetical protein  100 
 
 
53 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.038639  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05692  hypothetical protein  68.75 
 
 
62 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000079  hypothetical protein  67.35 
 
 
63 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.231186  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1408  hypothetical protein  72.5 
 
 
67 aa  60.5  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4779  hypothetical protein  75.61 
 
 
49 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.151068  unclonable  0.00000000788092 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1658  hypothetical protein  55.1 
 
 
76 aa  51.2  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.222694  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4421  hypothetical protein  78.38 
 
 
60 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0287  hypothetical protein  78.38 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000239094  hitchhiker  0.000000000863491 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2885  hypothetical protein  63.41 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4387  hypothetical protein  69.77 
 
 
52 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2391  hypothetical protein  58.14 
 
 
54 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.595265  hitchhiker  0.00196894 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0304  hypothetical protein  63.04 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000261079  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0292  hypothetical protein  66.67 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000163282  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0117  hypothetical protein  49.06 
 
 
53 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2863  hypothetical protein  52.38 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2649  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  41.6  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  normal  0.0307301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0299  hypothetical protein  59.57 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000880989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0300  hypothetical protein  65.85 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00679932  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0402  hypothetical protein  66.67 
 
 
54 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000918691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>