93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1507 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1507  putative flagellar hook-length control protein  100 
 
 
660 aa  1316    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.838135  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02883  polar flagellar hook-length control protein FliK  37.93 
 
 
768 aa  102  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0438685  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  37.96 
 
 
508 aa  99  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  43.16 
 
 
674 aa  95.5  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  35.04 
 
 
544 aa  89.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  34.31 
 
 
491 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  31.21 
 
 
585 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  33.82 
 
 
586 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3042  flagellar hook-length control protein  28.03 
 
 
723 aa  82  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835952  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  33.09 
 
 
579 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  32.85 
 
 
593 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2817  flagellar hook-length control protein  38.71 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0900744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  32.35 
 
 
527 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2303  polar flagellar hook-length control protein FliK  39.51 
 
 
407 aa  80.1  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3439  flagellar hook-length control protein  31.61 
 
 
567 aa  76.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  32.61 
 
 
512 aa  77  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  30.32 
 
 
427 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  41.77 
 
 
686 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  32.7 
 
 
568 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  30.99 
 
 
495 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  41.67 
 
 
623 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  29.24 
 
 
428 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0768  flagellar hook-length control protein  28.49 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.383944  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2931  flagellar hook-length control protein  35.8 
 
 
717 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3063  flagellar hook-length control protein  35.8 
 
 
718 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.954903  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1442  flagellar hook-length control protein  35.8 
 
 
702 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.822312  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2921  flagellar hook-length control protein  35.8 
 
 
537 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1989  flagellar hook-length control protein  32.71 
 
 
394 aa  67  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06190  flagellar protein  34.09 
 
 
434 aa  65.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0480838  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0493  flagellar hook-length control protein  34.52 
 
 
460 aa  65.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00976  flagellar protein  34.09 
 
 
434 aa  65.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1350  flagellar hook-length control protein  34.09 
 
 
480 aa  65.5  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2177  flagellar hook-length control protein-like  32.41 
 
 
485 aa  65.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.025521  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1605  putative flagellar hook-length control protein FliK  31.91 
 
 
360 aa  65.1  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.107418 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1964  Flagellar hook-length control protein-like protein  30.69 
 
 
324 aa  63.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1506  flagellar hook-length control protein  28.37 
 
 
421 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  0.0562001 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2905  flagellar hook-length control protein  30 
 
 
478 aa  62.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4361  flagellar hook-length control protein  27.66 
 
 
421 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1437  flagellar hook-length control protein  29.41 
 
 
650 aa  61.6  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0161  putative flagellar hook-length control protein  34.74 
 
 
487 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3114  flagellar hook-length control protein  33 
 
 
455 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1973  flagellar hook-length control protein  29.77 
 
 
373 aa  60.5  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  25.74 
 
 
487 aa  60.1  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2455  flagellar hook-length control protein  34.15 
 
 
452 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0513152  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3088  flagellar hook-length control protein  34.15 
 
 
456 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3069  flagellar hook-length control protein  34.15 
 
 
452 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127947  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2980  flagellar hook-length control protein  34.15 
 
 
455 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741778  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0412  flagellar hook-length control protein, putative  34.15 
 
 
677 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.711006  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3922  flagellar hook-length control protein  32 
 
 
421 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1966  flagellar hook-length control protein FliK  29.89 
 
 
474 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.471768  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6418  flagellar hook-length control protein  33.93 
 
 
447 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0217  flagellar hook-length control protein FliK  34.15 
 
 
455 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.478387  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2147  flagellar hook-length control protein  34.15 
 
 
458 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3686  flagellar hook-length control protein  32 
 
 
435 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2936  flagellar hook-length control protein  31.68 
 
 
503 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3276  flagellar hook-length control protein  33.73 
 
 
466 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0229  flagellar hook-length control protein FliK  34.15 
 
 
458 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3449  flagellar hook-length control protein  29.89 
 
 
467 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3405  flagellar hook-length control protein  33.73 
 
 
466 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0195  flagellar hook-length control protein, putative  31.4 
 
 
465 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3775  flagellar hook-length control protein  34.15 
 
 
497 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1163  flagellar hook-length control protein  34.67 
 
 
364 aa  57  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.193048  normal  0.0180974 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3066  flagellar hook-length control protein  32.93 
 
 
449 aa  57  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1544  flagellar hook-length control protein  30.1 
 
 
453 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.213285  normal  0.574566 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1960  flagellar hook-length control protein  26.03 
 
 
456 aa  52.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0471  flagellar hook-length control protein  29.59 
 
 
528 aa  51.6  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0059  flagellar hook-length control protein  27.96 
 
 
390 aa  51.2  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2045  flagellar hook-length control protein  29.25 
 
 
510 aa  51.2  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0259  flagellar hook-length control protein  35.53 
 
 
658 aa  51.2  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1875  flagellar hook-length control protein  28.57 
 
 
389 aa  51.2  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  0.436582 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0257  flagellar hook-length control protein  35.53 
 
 
674 aa  50.8  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3635  flagellar hook-length control protein  30.93 
 
 
438 aa  50.4  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.225852  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001169  flagellar hook-length control protein FliK  30.4 
 
 
357 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.272814  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0714  flagellar hook-length control protein  32.41 
 
 
369 aa  49.7  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3583  flagellar hook-length control protein  28.87 
 
 
334 aa  49.7  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04953  flagellar hook-length control protein  32.26 
 
 
351 aa  48.9  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1021  flagellar hook-length control protein  33.78 
 
 
490 aa  47.8  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2711  flagellar hook-length control protein  28.7 
 
 
465 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24180  Flagellar hook-length control protein  27.84 
 
 
461 aa  47.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0290673  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1539  flagellar hook-length control protein  28.75 
 
 
846 aa  46.2  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3076  flagellar hook-length control protein  32.53 
 
 
436 aa  46.2  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013987  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3802  flagellar hook-length control protein  32.53 
 
 
436 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101066  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5102  flagellar hook-length control protein  28.57 
 
 
487 aa  46.6  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290575  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1571  flagellar hook-length control protein  25.93 
 
 
443 aa  45.8  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5266  flagellar hook-length control protein  27.27 
 
 
495 aa  45.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.265097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2396  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
450 aa  45.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  29.76 
 
 
552 aa  45.4  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1886  flagellar hook-length control protein  24.69 
 
 
430 aa  45.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2295  flagellar hook-length control protein  32.81 
 
 
452 aa  45.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16830  flagellar hook-length control protein  23.76 
 
 
500 aa  44.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1291  hypothetical protein  30.91 
 
 
736 aa  44.7  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.544627  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1545  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
523 aa  45.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0438  flagellar hook-length control protein  23.58 
 
 
504 aa  44.3  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00196038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>