131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1473 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1473  putative flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  100 
 
 
230 aa  459  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1337  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.89 
 
 
257 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2600  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.58 
 
 
235 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1256  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.46 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1326  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.46 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1318  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.06 
 
 
235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212104 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1342  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.15 
 
 
235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.127049  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1594  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.76 
 
 
235 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32 
 
 
235 aa  122  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.44 
 
 
235 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.460047  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.87 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.292219  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02933  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.7 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870868  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3090  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2965  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.35 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.639269  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1413  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.35 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2950  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.86 
 
 
235 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.892014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.86 
 
 
235 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1158  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.91 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.623618  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1300  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.97 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004176  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  25.87 
 
 
248 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1795  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.51 
 
 
255 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01281  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.54 
 
 
248 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.64 
 
 
248 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  26.97 
 
 
243 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0940  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.7 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0970  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.25 
 
 
233 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  27.11 
 
 
238 aa  92  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.57 
 
 
250 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1540  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  24.58 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1926  flagellar protein, putative  27.05 
 
 
248 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3487  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.16 
 
 
252 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.7 
 
 
250 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.57 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.92 
 
 
232 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1175  SAF domain-containing protein  27.85 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.89 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.11 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.09 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2853  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.94 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.765883  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  26.04 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.12 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25.14 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  23.16 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0228  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.95 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.531559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0718  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.95 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.95 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0523  SAF domain-containing protein  24.68 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000741  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  31.76 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.34 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0919764  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06151  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.34 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000222326  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1524  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.57 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0070  SAF domain-containing protein  31.33 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1067  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  30.26 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106649  normal  0.0500277 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.54 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.669338  normal  0.182462 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0262  lateral flagellar P-ring addition protein LfgA  26.38 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1979  flageller protein FlgA  24.19 
 
 
251 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3372  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.88 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3323  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.34 
 
 
254 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3558  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  27.75 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2992  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.34 
 
 
254 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2101  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.34 
 
 
254 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  22.75 
 
 
237 aa  59.7  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594164  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4670  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  24.88 
 
 
252 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2925  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  24.18 
 
 
242 aa  59.3  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3972  SAF domain-containing protein  27.66 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1477  flageller protein FlgA  26.92 
 
 
245 aa  59.3  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0461  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.88 
 
 
254 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0239  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.4 
 
 
538 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3021  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.34 
 
 
388 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2947  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.61 
 
 
424 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3074  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  23.12 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2735  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  21.39 
 
 
255 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000036483 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6372  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.68 
 
 
320 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682175  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3469  SAF domain-containing protein  26.95 
 
 
245 aa  55.8  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0076  SAF domain-containing protein  25.9 
 
 
254 aa  55.8  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0265  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.63 
 
 
509 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0277  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.38 
 
 
507 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01068  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein A  26.14 
 
 
219 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2574  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.14 
 
 
219 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01076  hypothetical protein  26.14 
 
 
219 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2936  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.66 
 
 
418 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3713  flageller protein FlgA  23.21 
 
 
246 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0139  putative flagella basal body P-ring formation protein  23.77 
 
 
502 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3071  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.66 
 
 
315 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  25 
 
 
281 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2412  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.35 
 
 
310 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3026  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.35 
 
 
310 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.124973  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3045  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.45 
 
 
408 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.279341 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0860  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.29 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.869697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1195  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.57 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1195  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.14 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2528  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.57 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.728005  normal  0.0178665 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5624  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  22.67 
 
 
249 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3795  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  22.73 
 
 
504 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1997  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  20.16 
 
 
254 aa  52.8  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2057  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.44 
 
 
219 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  30.15 
 
 
240 aa  52.4  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3652  flageller protein FlgA  27.01 
 
 
222 aa  52  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1243  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.72 
 
 
220 aa  52  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.209748  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2325  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  20.16 
 
 
232 aa  52  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>