120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1352 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  842    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  33.74 
 
 		 404 aa  247  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  33.25 
 
 		 408 aa  239  8e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  33.25 
 
 		 408 aa  236  7e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  33.92 
 
 		 407 aa  236  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  32.92 
 
 		 404 aa  233  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  32.93 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  36.59 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  33.33 
 
 		 406 aa  226  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  33.17 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  31.85 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  32.17 
 
 		 413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  31.08 
 
 		 409 aa  210  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  32.33 
 
 		 403 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  33.77 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  32.69 
 
 		 411 aa  202  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  29.38 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  30.33 
 
 		 405 aa  196  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  30.05 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  30 
 
 		 416 aa  190  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  27.85 
 
 		 408 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  29.65 
 
 		 413 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  27.62 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  28.92 
 
 		 402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  30.53 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  27.15 
 
 		 413 aa  159  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  31.42 
 
 		 428 aa  156  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  27.75 
 
 		 415 aa  154  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  28.93 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  28.46 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  29.13 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  28.16 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  29.92 
 
 		 419 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  25.62 
 
 		 413 aa  149  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  28.42 
 
 		 400 aa  149  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  29.64 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  24.76 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  27.32 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  25.06 
 
 		 464 aa  146  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  24.46 
 
 		 422 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  26.09 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  28.26 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  26.63 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  29.86 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  25.78 
 
 		 429 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  28.65 
 
 		 411 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  25.42 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  28.98 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  25.12 
 
 		 431 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  25.25 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  26.23 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  25.12 
 
 		 431 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  26.23 
 
 		 423 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  26.16 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  25.14 
 
 		 404 aa  136  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  27.1 
 
 		 424 aa  133  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  25 
 
 		 423 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  24.45 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  26.58 
 
 		 428 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  27.01 
 
 		 405 aa  127  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  26.21 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  24.38 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  24.82 
 
 		 487 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  24.21 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  26.57 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  24.51 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  22.07 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  25.97 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  24.32 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  25.6 
 
 		 447 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  24.17 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  23.18 
 
 		 444 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  24.69 
 
 		 445 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  21.68 
 
 		 463 aa  89.7  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  33.88 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  33.88 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  21.69 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  22.43 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  23.06 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  22.09 
 
 		 480 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  21.06 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  23.37 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  25.19 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  24.46 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  25.41 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  23.89 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  23.62 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  29.92 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  23.42 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  18.76 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  29.93 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  22.5 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2044  putative signal transduction protein  21.38 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  24.84 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0662  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.71 
 
 		 742 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.47145e-25 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  23.29 
 
 		 409 aa  49.7  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.71 
 
 		 682 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1086  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.67 
 
 		 735 aa  47  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.63762  hitchhiker  0.0000000000000445452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  29.2 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>