More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1347 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1347  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 820 aa  1686    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1482  TonB-dependent receptor, putative  75.49 
 
 		 815 aa  1297    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2690  TonB-dependent receptor, plug  76.83 
 
 		 812 aa  1327    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228232 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3242  TonB-dependent receptor  83.41 
 
 		 811 aa  1429    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000414671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1306  TonB-dependent receptor plug  75.18 
 
 		 820 aa  1294    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000196501  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2930  TonB-dependent receptor plug  79.51 
 
 		 810 aa  1372    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1445  TonB-dependent receptor, plug  72.24 
 
 		 825 aa  1238    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000476077  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1237  TonB-dependent receptor, plug  74.39 
 
 		 814 aa  1283    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3803  TonB-dependent receptor, plug  48.53 
 
 		 807 aa  781    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2768  TonB-dependent receptor  74.88 
 
 		 823 aa  1286    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000855789  normal  0.291776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2846  TonB-dependent receptor  74.51 
 
 		 823 aa  1281    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000571125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3044  TonB-dependent receptor plug  72.79 
 
 		 821 aa  1260    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000527887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2440  TonB-dependent receptor, plug  71.55 
 
 		 825 aa  1254    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000351973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1342  TonB-dependent receptor plug  75.42 
 
 		 820 aa  1300    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00424571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  75.36 
 
 		 823 aa  1297    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.742035 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3375  TonB-dependent receptor plug  81.8 
 
 		 824 aa  1380    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31809  normal  0.581234 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1315  TonB-dependent receptor plug  73.04 
 
 		 821 aa  1263    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000529097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 749 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 748 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 748 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 740 aa  190  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 737 aa  190  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  24.91 
 
 		 738 aa  177  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  25.43 
 
 		 742 aa  173  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  24.8 
 
 		 742 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 720 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 712 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  25.09 
 
 		 714 aa  165  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 720 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 724 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  24.77 
 
 		 720 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 724 aa  162  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.12 
 
 		 720 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  24.78 
 
 		 723 aa  161  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 713 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  22.56 
 
 		 757 aa  131  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 776 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  23.07 
 
 		 707 aa  129  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 715 aa  127  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  23.85 
 
 		 724 aa  125  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  23.48 
 
 		 708 aa  122  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  23.41 
 
 		 711 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  23.24 
 
 		 814 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 720 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  22.34 
 
 		 701 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.83 
 
 		 713 aa  114  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 711 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 		 712 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  31.44 
 
 		 699 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  22.74 
 
 		 706 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  23.11 
 
 		 706 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  22.68 
 
 		 708 aa  108  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  23.34 
 
 		 721 aa  108  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 701 aa  107  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 770 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  22.73 
 
 		 702 aa  105  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  36.52 
 
 		 810 aa  104  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 710 aa  104  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  22.99 
 
 		 706 aa  104  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  33.16 
 
 		 701 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  33.16 
 
 		 701 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  22.54 
 
 		 709 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  22.49 
 
 		 767 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  33.16 
 
 		 701 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  22.54 
 
 		 703 aa  103  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 707 aa  103  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 710 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 		 719 aa  102  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 		 702 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 		 702 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 		 806 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 722 aa  101  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  23.41 
 
 		 697 aa  101  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  36.6 
 
 		 710 aa  101  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 		 705 aa  100  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 795 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  22.51 
 
 		 709 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.27 
 
 		 797 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 		 710 aa  99.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 		 709 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.86 
 
 		 806 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 809 aa  100  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  28.97 
 
 		 715 aa  99.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 		 701 aa  99.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  36.78 
 
 		 708 aa  99.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 722 aa  100  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  34.04 
 
 		 701 aa  99.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  37.43 
 
 		 778 aa  100  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  34.04 
 
 		 701 aa  99.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  35.88 
 
 		 721 aa  99  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 		 706 aa  98.6  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  33.52 
 
 		 837 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  22.35 
 
 		 703 aa  98.6  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  23.36 
 
 		 692 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2846  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.39 
 
 		 728 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306235  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  21.51 
 
 		 697 aa  97.4  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 815 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  34.24 
 
 		 708 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 881 aa  96.3  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 881 aa  96.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>