124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1336 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  67.24 
 
 		 234 aa  321  7e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  60 
 
 		 267 aa  316  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  64.1 
 
 		 234 aa  316  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  65.53 
 
 		 235 aa  315  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  63.68 
 
 		 234 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  65.82 
 
 		 239 aa  310  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  59 
 
 		 239 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  58.58 
 
 		 239 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  58.16 
 
 		 239 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  58.97 
 
 		 234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  56.03 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  37.29 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  32.44 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  32.9 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  32.9 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  31.82 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  32.47 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  32.47 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  33.06 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  30.58 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  30.91 
 
 		 240 aa  91.7  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  33.5 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  31.96 
 
 		 245 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  31.02 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  31.02 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  30.61 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  30.61 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  30.61 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  31.02 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  31.02 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  31.16 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  35.68 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  30.2 
 
 		 230 aa  88.6  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  42.75 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  36.04 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  32.23 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  30.65 
 
 		 234 aa  85.1  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  28.06 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  28.3 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  37.12 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  31.02 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  47.47 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  41.55 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  32.26 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  31.03 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  29.28 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  28.22 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  38.28 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  45.19 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4694  hypothetical protein  29.03 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  32.61 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  30.73 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  37.1 
 
 		 273 aa  75.1  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4047  hypothetical protein  28.23 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3838  hypothetical protein  27.82 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3931  hypothetical protein  27.82 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  35.48 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  40 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  40.74 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4388  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  36.96 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  41.51 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4213  hypothetical protein  28.57 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0128  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1989  hypothetical protein  27.73 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4252  hypothetical protein  28.76 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  39.09 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  39.25 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  45.45 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  36 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3552  hypothetical protein  26.27 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3348  hypothetical protein  27.43 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00245935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  35.25 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0151  hypothetical protein  28.63 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  28.75 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  39.45 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  39.45 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0030  hypothetical protein  27.07 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00621032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  37.39 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  34.97 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  35.83 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0130  hypothetical protein  26.87 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0341016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  33.55 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  30.99 
 
 		 269 aa  62  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  41.57 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1829  hypothetical protein  25.29 
 
 		 253 aa  61.6  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  35.78 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  36.89 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  39.13 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  37.7 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  36.04 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  41.58 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  33.8 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  29.25 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  29.94 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  34.13 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  38.04 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0466  hypothetical protein  42.86 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>