More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1271 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  100 
 
 
461 aa  956    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  47.13 
 
 
436 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  48.74 
 
 
437 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  47.06 
 
 
444 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  47.36 
 
 
436 aa  425  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  48.05 
 
 
437 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  48.05 
 
 
437 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  48.05 
 
 
437 aa  412  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  48.63 
 
 
439 aa  412  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  45.93 
 
 
441 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  45.7 
 
 
441 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  46.15 
 
 
441 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  45.7 
 
 
441 aa  408  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  45.7 
 
 
441 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  47.13 
 
 
438 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  47.13 
 
 
438 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  47.13 
 
 
438 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  47.13 
 
 
438 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  45.7 
 
 
441 aa  408  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  45.02 
 
 
444 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  47.36 
 
 
438 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  45.7 
 
 
441 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  45.7 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  46.9 
 
 
437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  45.7 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  44.8 
 
 
444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  44.87 
 
 
436 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  46.19 
 
 
441 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  46.42 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  43.71 
 
 
444 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  46.09 
 
 
445 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  43.71 
 
 
439 aa  395  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  45.96 
 
 
441 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  43.44 
 
 
444 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  45.58 
 
 
443 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  43.21 
 
 
444 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  45.39 
 
 
442 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  43.67 
 
 
444 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  43.67 
 
 
444 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  42.53 
 
 
444 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  43.67 
 
 
444 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  43.42 
 
 
443 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  42.73 
 
 
444 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  43.49 
 
 
454 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  43.61 
 
 
439 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  43.94 
 
 
437 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  44.17 
 
 
439 aa  373  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  42.7 
 
 
454 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  40.92 
 
 
443 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  44.24 
 
 
437 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  42.79 
 
 
439 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  43.02 
 
 
439 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  42.51 
 
 
439 aa  360  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  42 
 
 
435 aa  360  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  41.69 
 
 
440 aa  358  8e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  39.28 
 
 
446 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  39.28 
 
 
446 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  42.5 
 
 
446 aa  347  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  41.65 
 
 
434 aa  346  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  40.82 
 
 
414 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  41.1 
 
 
436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  39.47 
 
 
464 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  40.18 
 
 
436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  41.11 
 
 
461 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  39.25 
 
 
464 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  39.82 
 
 
461 aa  339  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  41.29 
 
 
458 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  41.47 
 
 
433 aa  335  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2399  peptidase M24  40.27 
 
 
435 aa  335  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1451  peptidase M24  40.45 
 
 
447 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  41.91 
 
 
449 aa  334  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  38.7 
 
 
499 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5262  peptidase M24  39.91 
 
 
464 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  42.11 
 
 
436 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  41.67 
 
 
452 aa  332  9e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  38.56 
 
 
458 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0432  aminopeptidase P  40.09 
 
 
465 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386273  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  39.22 
 
 
439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  39.87 
 
 
514 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0662  peptidase M24  39.6 
 
 
461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6000  peptidase M24  38.12 
 
 
441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0211  peptidase M24  39.38 
 
 
461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  38.76 
 
 
462 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.429272 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0695  peptidase M24  39.38 
 
 
461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  40.37 
 
 
442 aa  326  5e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3277  peptidase M24  41.24 
 
 
442 aa  326  5e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.609187  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4829  aminopeptidase P  39.22 
 
 
462 aa  326  6e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.839316  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  39.78 
 
 
474 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  40.45 
 
 
454 aa  324  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  38.75 
 
 
459 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  38.23 
 
 
473 aa  323  5e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0086  peptidase M24  38.95 
 
 
469 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875137  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  40.14 
 
 
442 aa  320  5e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1524  aminopeptidase P  40 
 
 
430 aa  319  9e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0210879  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1577  peptidase M24  42.09 
 
 
455 aa  318  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0925  peptidase M24  39.96 
 
 
460 aa  318  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0623  aminopeptidase P  39.1 
 
 
468 aa  316  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920846  normal  0.361918 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18411  putative aminopeptidase P  38.57 
 
 
439 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.502832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2176  aminopeptidase P  41.85 
 
 
426 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2816  peptidase M24  39.17 
 
 
441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000333195  normal  0.738801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>