43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1246 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  100 
 
 		 147 aa  301  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3257  hypothetical protein  30.15 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  29.58 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  27.42 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  26.45 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3706  hypothetical protein  30.77 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  25.17 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  38.46 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2546  hypothetical protein  23.81 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0786863  hitchhiker  0.000802946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  23.91 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  30.19 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3301  hypothetical protein  27.03 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1993  hypothetical protein  33.75 
 
 		 224 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  29.56 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  28.93 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  38.03 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  26.42 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  24.26 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2275  hypothetical protein  40.74 
 
 		 342 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0699286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  39.06 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  50 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  26 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  36.96 
 
 		 217 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  47.5 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2624  hypothetical protein  20.14 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  57.58 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  57.58 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0521  hypothetical protein  22.67 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759157 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0526  hypothetical protein  22.67 
 
 		 162 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.182831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  21.77 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  42.22 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  45 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  45.95 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2860  hypothetical protein  41.86 
 
 		 150 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  45.95 
 
 		 177 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  45.95 
 
 		 177 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  32.5 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 208 aa  40.8  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  26.17 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  25.17 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  29.87 
 
 		 211 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  22.02 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0851  hypothetical protein  34.55 
 
 		 544 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>