251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1206 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  100 
 
 		 340 aa  695    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  40.13 
 
 		 308 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  40.51 
 
 		 314 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  38.05 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  39.12 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  36.96 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  35.16 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  40 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  39.68 
 
 		 314 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  39.24 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  38.7 
 
 		 321 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  38.24 
 
 		 315 aa  198  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  38.71 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  38.39 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  37.46 
 
 		 314 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  37.46 
 
 		 313 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  35.88 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  32.81 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  30.79 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  28.85 
 
 		 361 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000269892  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  30.29 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000245606  unclonable  0.000000000165223 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  28.33 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  27.25 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1973  porin  29.39 
 
 		 349 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  28.38 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  28.12 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  28.61 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3252  porin  28.03 
 
 		 352 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000145814  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0545  outer membrane porin, putative  27.9 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00179021  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3227  outer membrane porin, putative  28.41 
 
 		 354 aa  122  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101033  hitchhiker  0.000000540368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0762  outer membrane porin, putative  27.65 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000457647  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0815  porin Gram-negative type  28.29 
 
 		 354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00496289  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0790  porin  28.29 
 
 		 354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000041631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0590  porin  26.89 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124003  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  26.8 
 
 		 347 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0822  porin  28.29 
 
 		 354 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0441851  normal  0.422579 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  27.51 
 
 		 346 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3569  porin  28.01 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136982  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2278  porin  26.47 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134296  normal  0.609479 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  25.97 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  31.99 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  25.97 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  26.54 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000331419  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0734  porin  28.7 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000494692  decreased coverage  0.0000362774 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0589  porin  26.01 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486852  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4008  porin  27.38 
 
 		 354 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000296209  hitchhiker  0.0000000599213 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  26.63 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  24.93 
 
 		 365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3896  outer membrane porin, putative  25.07 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0781  porin  27.92 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000021464  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  26.54 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2092  porin  27.6 
 
 		 346 aa  106  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.078027  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2587  porin  27.89 
 
 		 351 aa  106  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0811  outer membrane porin, putative  28.46 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2403  outer membrane porin, putative  26.75 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.987816  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1420  outer membrane porin, putative  25.3 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  26.76 
 
 		 362 aa  86.7  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  25.32 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  25.08 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  25.67 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  30.82 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  27.61 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1877  porin  31.52 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000050808  unclonable  0.0000817359 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2038  porin  26.06 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3847  porin  25.32 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2793  porin  23.16 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  24.2 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1642  porin  29.51 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000869717  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0155  porin  28.05 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0545  OmpC family outer membrane porin  28.11 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  20.87 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  25.13 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  25.3 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2472  porin  24.07 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0827968  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1671  porin  25.66 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  23.81 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  24.4 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  22.85 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  24.4 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0613  porin  25.74 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0640  porin  25.74 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  24.4 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0635  outer membrane insertion C-terminal signal  25.74 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0265  porin  24.86 
 
 		 373 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0179073  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  25.28 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  24.51 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3752  porin  25.74 
 
 		 355 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  25.15 
 
 		 376 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3619  porin  26.3 
 
 		 319 aa  53.5  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00814713  hitchhiker  0.000626755 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  24.79 
 
 		 386 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  24.79 
 
 		 386 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  24.51 
 
 		 386 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  24.65 
 
 		 393 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  24.51 
 
 		 386 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  25.08 
 
 		 372 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  24.44 
 
 		 376 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  24.86 
 
 		 380 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  22.43 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  22.43 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  24.42 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>