228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0986 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  100 
 
 		 726 aa  1462    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  62 
 
 		 713 aa  917    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 444 aa  224  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 416 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 471 aa  206  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 417 aa  204  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  30.66 
 
 		 426 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 427 aa  198  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 421 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  30.14 
 
 		 411 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 417 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 418 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 418 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 436 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 418 aa  185  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  31.65 
 
 		 427 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 429 aa  182  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 430 aa  181  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  30.31 
 
 		 418 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  30.31 
 
 		 418 aa  179  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 428 aa  179  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 443 aa  179  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 409 aa  179  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 424 aa  177  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 447 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 412 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 429 aa  172  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  28.26 
 
 		 412 aa  170  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  28.02 
 
 		 412 aa  170  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 412 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 446 aa  168  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 415 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  28.05 
 
 		 429 aa  162  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  30.85 
 
 		 429 aa  161  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 432 aa  161  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  28.95 
 
 		 397 aa  160  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 452 aa  158  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 432 aa  158  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 446 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 447 aa  157  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  28.16 
 
 		 444 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 471 aa  157  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  26.67 
 
 		 410 aa  156  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 411 aa  156  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 408 aa  156  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  26.3 
 
 		 411 aa  155  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 431 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 473 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 436 aa  151  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 430 aa  151  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  29.44 
 
 		 427 aa  150  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 443 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  29.49 
 
 		 412 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 432 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 433 aa  149  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 454 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 444 aa  147  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  27.46 
 
 		 465 aa  146  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  29.21 
 
 		 443 aa  146  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 420 aa  144  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  25.46 
 
 		 520 aa  143  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 459 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 433 aa  136  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 480 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 480 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 480 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  24.17 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  24.88 
 
 		 434 aa  134  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 425 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  24.63 
 
 		 434 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  23.52 
 
 		 474 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 436 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 474 aa  127  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  24.39 
 
 		 438 aa  127  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0467  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 439 aa  126  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.677382 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 481 aa  126  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  24.39 
 
 		 438 aa  126  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 476 aa  125  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 476 aa  125  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  23.93 
 
 		 474 aa  124  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 464 aa  123  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 446 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 446 aa  121  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 446 aa  121  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0101  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 426 aa  110  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  26.32 
 
 		 412 aa  108  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  25.92 
 
 		 382 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 382 aa  106  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  25.92 
 
 		 382 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  25.92 
 
 		 382 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  25.92 
 
 		 382 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  25.92 
 
 		 382 aa  106  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  25.92 
 
 		 382 aa  106  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  26.4 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  26.91 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  26.69 
 
 		 396 aa  103  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  25.98 
 
 		 382 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  25.65 
 
 		 414 aa  102  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>