200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0983 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 836 aa  1738    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  51.86 
 
 		 839 aa  894    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  49.75 
 
 		 821 aa  814    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  31.07 
 
 		 770 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  29.55 
 
 		 801 aa  348  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  28.78 
 
 		 828 aa  327  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  27.41 
 
 		 779 aa  318  4e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  27.21 
 
 		 836 aa  317  8e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  28.74 
 
 		 799 aa  312  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  28.59 
 
 		 794 aa  300  9e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  28.75 
 
 		 821 aa  298  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  28.27 
 
 		 797 aa  295  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  26.13 
 
 		 752 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  28.81 
 
 		 803 aa  283  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  27.06 
 
 		 777 aa  278  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  28.44 
 
 		 776 aa  276  8e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  27.5 
 
 		 785 aa  276  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  27.31 
 
 		 783 aa  270  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  27.69 
 
 		 798 aa  269  1e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  27.48 
 
 		 779 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  28.44 
 
 		 768 aa  268  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  25.76 
 
 		 746 aa  260  9e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  27.65 
 
 		 779 aa  259  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  27.83 
 
 		 806 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  33.07 
 
 		 840 aa  257  6e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  30.78 
 
 		 1024 aa  249  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  26.09 
 
 		 825 aa  241  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  27.1 
 
 		 792 aa  239  1e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2529  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 		 1010 aa  239  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.24 
 
 		 973 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  27.01 
 
 		 760 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  26.44 
 
 		 791 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  27.95 
 
 		 765 aa  230  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  28.62 
 
 		 765 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  27.03 
 
 		 749 aa  229  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  25.79 
 
 		 791 aa  228  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  26.92 
 
 		 774 aa  228  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  24.48 
 
 		 728 aa  227  7e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  25.79 
 
 		 789 aa  227  9e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  29.91 
 
 		 815 aa  225  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  27.41 
 
 		 845 aa  224  4.9999999999999996e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  25.7 
 
 		 743 aa  224  4.9999999999999996e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  25.82 
 
 		 795 aa  224  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  25.82 
 
 		 795 aa  224  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  26.43 
 
 		 679 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.95 
 
 		 788 aa  223  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  26.43 
 
 		 679 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  25.51 
 
 		 775 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  26.29 
 
 		 679 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.19 
 
 		 787 aa  222  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  25.46 
 
 		 679 aa  221  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  28.74 
 
 		 951 aa  220  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  26.14 
 
 		 679 aa  220  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  25.93 
 
 		 764 aa  219  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  24.47 
 
 		 779 aa  219  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  26.14 
 
 		 679 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  27.24 
 
 		 806 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  26.07 
 
 		 764 aa  219  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  28.64 
 
 		 944 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.88 
 
 		 788 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.48 
 
 		 788 aa  218  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  25.58 
 
 		 772 aa  217  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  26.95 
 
 		 790 aa  217  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  29.32 
 
 		 969 aa  217  8e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  26.1 
 
 		 661 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 799 aa  216  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 		 799 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  25.12 
 
 		 784 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  26.09 
 
 		 771 aa  213  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  26.42 
 
 		 668 aa  212  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.4 
 
 		 791 aa  211  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  26.91 
 
 		 777 aa  210  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  27.1 
 
 		 700 aa  209  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  26.96 
 
 		 757 aa  209  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 		 778 aa  208  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  25.54 
 
 		 828 aa  208  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  24.27 
 
 		 770 aa  207  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  25.4 
 
 		 791 aa  207  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  25.95 
 
 		 763 aa  203  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  25.2 
 
 		 695 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  25.8 
 
 		 775 aa  201  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05150  alpha glucosidase, putative  30.3 
 
 		 956 aa  200  7.999999999999999e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133027  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  27.63 
 
 		 795 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  24.73 
 
 		 760 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  23.26 
 
 		 692 aa  198  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50836  alpha subunit of glucosidase  27.06 
 
 		 712 aa  195  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.312978  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  27.92 
 
 		 661 aa  194  6e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  27.37 
 
 		 687 aa  194  8e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  28.19 
 
 		 911 aa  193  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  25.64 
 
 		 681 aa  193  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  25.44 
 
 		 780 aa  192  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  25.45 
 
 		 766 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  28.07 
 
 		 794 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  23.61 
 
 		 816 aa  191  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  26.81 
 
 		 685 aa  191  5e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  26.38 
 
 		 695 aa  190  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  26.77 
 
 		 690 aa  188  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  26.16 
 
 		 760 aa  188  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  23.34 
 
 		 752 aa  187  6e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  27.38 
 
 		 995 aa  187  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>