More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0756 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  100 
 
 		 993 aa  2035    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  33.67 
 
 		 1366 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  33.09 
 
 		 1343 aa  283  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  31 
 
 		 1347 aa  281  4e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  30.33 
 
 		 1335 aa  274  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  32 
 
 		 1344 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  31.64 
 
 		 1298 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  32.84 
 
 		 1311 aa  268  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  31.98 
 
 		 663 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  31.38 
 
 		 1384 aa  266  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  32.47 
 
 		 1378 aa  266  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 		 1370 aa  265  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 940 aa  263  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.42 
 
 		 1396 aa  260  8e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  29.58 
 
 		 1397 aa  258  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  32.03 
 
 		 1374 aa  258  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  33.21 
 
 		 1344 aa  257  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 677 aa  257  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  32.78 
 
 		 934 aa  257  9e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 904 aa  252  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  29.52 
 
 		 1355 aa  251  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  29.5 
 
 		 1400 aa  251  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  32.73 
 
 		 1306 aa  248  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  30.83 
 
 		 1374 aa  247  6.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  30.91 
 
 		 1347 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  28.62 
 
 		 1340 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  29.38 
 
 		 961 aa  242  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  32.07 
 
 		 1278 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  29.53 
 
 		 1373 aa  239  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  31.56 
 
 		 1355 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  28.77 
 
 		 1418 aa  236  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  30.55 
 
 		 1373 aa  236  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  29.56 
 
 		 1376 aa  232  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  28.6 
 
 		 1366 aa  232  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  29.89 
 
 		 1388 aa  231  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  30.25 
 
 		 1404 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  32.91 
 
 		 1172 aa  228  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  30.82 
 
 		 1378 aa  227  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  28.78 
 
 		 1342 aa  222  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 1341 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  28.17 
 
 		 1349 aa  221  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  28.12 
 
 		 1363 aa  219  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  33.26 
 
 		 1156 aa  218  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  29.95 
 
 		 1324 aa  217  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  29.25 
 
 		 1334 aa  217  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  29.03 
 
 		 1374 aa  214  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  33 
 
 		 1202 aa  213  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 1118 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 1010 aa  213  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  29.57 
 
 		 1327 aa  213  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1390 aa  212  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 		 668 aa  211  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 1431 aa  211  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 1140 aa  211  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1390 aa  211  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1390 aa  211  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 		 1559 aa  211  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 1131 aa  211  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  27.98 
 
 		 1313 aa  210  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 979 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 1153 aa  209  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  29.49 
 
 		 1316 aa  208  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.07 
 
 		 1301 aa  206  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.93 
 
 		 1180 aa  207  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  31.21 
 
 		 919 aa  206  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 1711 aa  205  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  30.75 
 
 		 1299 aa  204  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  27.82 
 
 		 1296 aa  204  9e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 1013 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.86 
 
 		 1514 aa  201  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 1002 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 1370 aa  200  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.88 
 
 		 1406 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.64 
 
 		 1514 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  28.39 
 
 		 1414 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 1383 aa  199  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 		 1426 aa  197  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 1048 aa  196  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  28.99 
 
 		 1152 aa  194  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 1361 aa  193  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  31.48 
 
 		 1427 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 1385 aa  191  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 1415 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 978 aa  191  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 1631 aa  191  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00426  putative two-component system sensor kinase/response regulator fusion protein  24.86 
 
 		 1280 aa  190  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 		 975 aa  189  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 1651 aa  188  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 1287 aa  188  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 1003 aa  184  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.09 
 
 		 1051 aa  184  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  29.93 
 
 		 863 aa  183  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 		 977 aa  182  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 1383 aa  181  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 1645 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 		 1646 aa  179  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.44 
 
 		 1021 aa  178  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 		 823 aa  177  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 		 1248 aa  177  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  33.57 
 
 		 1207 aa  177  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>