26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0733 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0733  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  801    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4131  hypothetical protein  46.95 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0130576 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3969  hypothetical protein  45.62 
 
 		 390 aa  332  6e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0578  hypothetical protein  46.29 
 
 		 385 aa  329  4e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.056117  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0603  hypothetical protein  45.97 
 
 		 386 aa  329  6e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0546  hypothetical protein  44.58 
 
 		 394 aa  316  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0844  hypothetical protein  43.7 
 
 		 389 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.969791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0837  hypothetical protein  45.11 
 
 		 389 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.240462  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2971  hypothetical protein  44.31 
 
 		 399 aa  311  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0812  hypothetical protein  43.19 
 
 		 389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000162038  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3158  hypothetical protein  44.7 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0013201  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3329  hypothetical protein  43.11 
 
 		 385 aa  307  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3523  hypothetical protein  43.12 
 
 		 384 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0015438  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3441  hypothetical protein  43.59 
 
 		 385 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00415893  normal  0.25947 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0693  hypothetical protein  42.86 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226756  normal  0.897132 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0835  hypothetical protein  44.22 
 
 		 385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3221  hypothetical protein  47.09 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0332861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2117  secreted protein  31.74 
 
 		 415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4467  secreted protein  35.07 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2682  hypothetical protein  31.74 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1934  hypothetical protein  32.25 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2869  hypothetical protein  27.16 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6996  hypothetical protein  33.46 
 
 		 500 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00620  hypothetical protein  26.75 
 
 		 553 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.486509  normal  0.628936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0052  hypothetical protein  31.16 
 
 		 553 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28742  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17670  hypothetical protein  44.44 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.276623  normal  0.654681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>