More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0659 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  608  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4772  AraC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 293 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  43.26 
 
 		 303 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1378  AraC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 293 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  37.98 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18110  transcriptional regulator MmsR  37.41 
 
 		 307 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1573  transcriptional regulator MmsR  37.07 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  32.4 
 
 		 300 aa  151  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.18 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  29.35 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.96 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2431  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  26.22 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.690566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0415  AraC family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0347  AraC family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 		 292 aa  99.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  29.69 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  28.27 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  21.95 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  26.1 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  25.66 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 278 aa  89.7  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  24.1 
 
 		 282 aa  89  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 361 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  24.09 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  23.33 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  27.23 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  32.09 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1012  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  34.26 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2354  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  35.87 
 
 		 160 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  38.04 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  41.3 
 
 		 513 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0920  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0175793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  25.69 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3711  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 533 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 196 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  34.23 
 
 		 515 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7100  transcriptional regulator, AraC family  25.32 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723966  normal  0.268951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2824  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.60964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  25.74 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2418  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2912  AraC family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  32.82 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  23.67 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  29.08 
 
 		 538 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  29.2 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4820  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3119  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.1 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00676861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 360 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2677  transcriptional regulator, AraC family  24.33 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3772  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  32.03 
 
 		 198 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  35.48 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  30 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  21.19 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3203  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0773  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3942  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>