More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0648 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1532  ferrous iron transport protein B  48 
 
 		 764 aa  687    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01364  hypothetical protein  45.97 
 
 		 758 aa  636    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0648  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 727 aa  1479    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1784  ferrous iron transport protein B  49.48 
 
 		 764 aa  713    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2258  ferrous iron transport protein FeoB  46.53 
 
 		 758 aa  655    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.694686  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1584  ferrous iron transport protein B  48.95 
 
 		 764 aa  705    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000129381  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1595  ferrous iron transport protein B  48.82 
 
 		 764 aa  704    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000195581  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1618  ferrous iron transport protein B  48.95 
 
 		 764 aa  704    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00477082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2414  ferrous iron transport protein B  47.7 
 
 		 772 aa  714    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3122  ferrous iron transport protein B  48.71 
 
 		 764 aa  712    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440223 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2504  ferrous iron transport protein B  49.15 
 
 		 764 aa  708    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112841  hitchhiker  0.00221536 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2572  ferrous iron transport protein B  49.48 
 
 		 764 aa  708    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148151  normal  0.0102392 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2616  ferrous iron transport protein B  47.47 
 
 		 770 aa  687    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1481  ferrous iron transport protein B  48.62 
 
 		 764 aa  705    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.725722  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2759  ferrous iron transport protein B  48.82 
 
 		 764 aa  702    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383541  hitchhiker  0.00159456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2670  ferrous iron transport protein B  48.95 
 
 		 764 aa  705    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.360786  normal  0.0737302 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2690  ferrous iron transport protein B  49.41 
 
 		 764 aa  719    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.878145  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1215  ferrous iron transport protein B  48.76 
 
 		 764 aa  678    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2517  ferrous iron transport protein B  49.02 
 
 		 764 aa  710    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.487661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004103  ferrous iron transport protein B  45.47 
 
 		 758 aa  622  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1664  ferrous iron transport protein B  43.78 
 
 		 758 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  43.08 
 
 		 776 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  42.89 
 
 		 786 aa  587  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  43.32 
 
 		 774 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  40.9 
 
 		 774 aa  570  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  43.42 
 
 		 770 aa  570  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  43.5 
 
 		 770 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  42.74 
 
 		 786 aa  560  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0321  ferrous iron transport protein B  42.08 
 
 		 751 aa  559  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.397467  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  40.94 
 
 		 783 aa  555  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1841  ferrous iron transport protein B  40.31 
 
 		 769 aa  547  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.547404  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  40.99 
 
 		 778 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  38.06 
 
 		 766 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  38.39 
 
 		 766 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2711  ferrous iron transporter B  40.6 
 
 		 751 aa  509  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2584  ferrous iron transporter B  40.21 
 
 		 751 aa  506  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3383  ferrous iron transport protein B  37.89 
 
 		 683 aa  508  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  38.22 
 
 		 778 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1959  ferrous iron transport protein B  36.74 
 
 		 816 aa  477  1e-133  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0239  ferrous iron transport protein B  36.74 
 
 		 816 aa  478  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  36.59 
 
 		 778 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0654  ferrous iron transport protein B  38.38 
 
 		 693 aa  465  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3779  ferrous iron transport protein B  38.08 
 
 		 772 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4629  ferrous iron transport protein B  38.24 
 
 		 771 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3822  ferrous iron transport protein B  39.46 
 
 		 772 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.848053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3746  ferrous iron transport protein B  37.71 
 
 		 771 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03261  ferrous iron transport protein B  38.25 
 
 		 773 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.313443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0304  ferrous iron transport protein B  38.38 
 
 		 773 aa  452  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03213  hypothetical protein  38.25 
 
 		 773 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.267012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4716  ferrous iron transport protein B  38.01 
 
 		 773 aa  452  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0304  ferrous iron transport protein B  38.01 
 
 		 773 aa  452  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0656913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3884  ferrous iron transport protein B  38.01 
 
 		 773 aa  452  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3813  ferrous iron transport protein B  37.95 
 
 		 772 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3704  ferrous iron transport protein B  37.82 
 
 		 772 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3690  ferrous iron transport protein B  38.25 
 
 		 773 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3606  ferrous iron transport protein B  38.01 
 
 		 773 aa  452  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3790  ferrous iron transport protein B  38.25 
 
 		 773 aa  451  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0168  ferrous iron transport protein B  37.71 
 
 		 771 aa  452  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426324  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3707  ferrous iron transport protein B  37.95 
 
 		 772 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3985  ferrous iron transport protein B  37.71 
 
 		 771 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3875  ferrous iron transport protein B  37.95 
 
 		 772 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2524  ferrous iron transport protein B  35.07 
 
 		 766 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2152  ferrous iron transport protein B  35.07 
 
 		 782 aa  435  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264076  hitchhiker  0.0000442692 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  32.44 
 
 		 713 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  31.16 
 
 		 741 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  35.31 
 
 		 631 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  34.39 
 
 		 631 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  33.25 
 
 		 741 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  32.42 
 
 		 728 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  31.98 
 
 		 747 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  31.34 
 
 		 743 aa  366  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  32.24 
 
 		 740 aa  366  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  32.11 
 
 		 587 aa  362  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  32.26 
 
 		 587 aa  359  8e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  32.49 
 
 		 740 aa  359  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  31.4 
 
 		 669 aa  352  2e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  31.18 
 
 		 738 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  30.82 
 
 		 669 aa  348  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  31.56 
 
 		 680 aa  346  8.999999999999999e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  33.42 
 
 		 662 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  33.42 
 
 		 662 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  33.42 
 
 		 662 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  33.42 
 
 		 662 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  32.28 
 
 		 662 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  32.7 
 
 		 662 aa  342  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  32.61 
 
 		 662 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  32.1 
 
 		 662 aa  340  4e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  31.97 
 
 		 662 aa  340  5e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  32.61 
 
 		 664 aa  340  7e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  31.83 
 
 		 662 aa  339  9e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  32.61 
 
 		 662 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  32.49 
 
 		 715 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  30.65 
 
 		 721 aa  325  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0894  ferrous iron transport protein B  32.41 
 
 		 741 aa  322  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.828262 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  30.83 
 
 		 666 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  32.13 
 
 		 714 aa  319  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  31.59 
 
 		 665 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  30.35 
 
 		 712 aa  316  9e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  31.15 
 
 		 669 aa  316  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  29.86 
 
 		 664 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>