244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0605 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  46.03 
 
 		 696 aa  646    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  100 
 
 		 747 aa  1561    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  52.13 
 
 		 699 aa  757    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  45.37 
 
 		 709 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  44.95 
 
 		 726 aa  649    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  46.59 
 
 		 700 aa  655    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  43.9 
 
 		 701 aa  637    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  51.86 
 
 		 722 aa  766    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  52.25 
 
 		 704 aa  767    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  52.86 
 
 		 705 aa  773    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  52.25 
 
 		 704 aa  767    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  52.32 
 
 		 699 aa  766    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  52.34 
 
 		 699 aa  761    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  52.72 
 
 		 704 aa  769    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  52.34 
 
 		 699 aa  760    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  50.94 
 
 		 709 aa  765    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  53.95 
 
 		 703 aa  836    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  52.72 
 
 		 704 aa  769    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  43.75 
 
 		 727 aa  628  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  43.61 
 
 		 702 aa  628  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  43.63 
 
 		 701 aa  628  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  44.14 
 
 		 716 aa  620  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  44.03 
 
 		 702 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  44.03 
 
 		 702 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  42.17 
 
 		 701 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  42.88 
 
 		 553 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  33 
 
 		 933 aa  419  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0090  hypothetical protein  38.26 
 
 		 449 aa  315  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3409  hypothetical protein  36.05 
 
 		 455 aa  286  8e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  29.27 
 
 		 439 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  28.54 
 
 		 447 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  28.21 
 
 		 430 aa  168  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  31.75 
 
 		 252 aa  144  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  26.11 
 
 		 446 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01670  conserved hypothetical protein  25.05 
 
 		 1020 aa  120  7.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  32.83 
 
 		 252 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  24.47 
 
 		 442 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  25.48 
 
 		 439 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  26.15 
 
 		 429 aa  112  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  25.07 
 
 		 433 aa  104  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  26.83 
 
 		 437 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  24.79 
 
 		 766 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  24.29 
 
 		 429 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  27.72 
 
 		 468 aa  101  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  26.24 
 
 		 506 aa  101  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  24.7 
 
 		 416 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10996  DUF323 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15650)  23.97 
 
 		 512 aa  99.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.742402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.7 
 
 		 416 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  24.6 
 
 		 417 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  24.83 
 
 		 446 aa  95.9  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  24.02 
 
 		 432 aa  96.3  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  26.02 
 
 		 424 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  26.78 
 
 		 442 aa  95.1  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  25.5 
 
 		 819 aa  95.1  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  24.07 
 
 		 425 aa  94  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  26.57 
 
 		 487 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  24.51 
 
 		 434 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  26.17 
 
 		 412 aa  91.3  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  25.28 
 
 		 383 aa  90.9  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  24.51 
 
 		 434 aa  90.1  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  24.93 
 
 		 432 aa  89.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  25.41 
 
 		 447 aa  88.6  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  28.67 
 
 		 398 aa  88.6  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  24.11 
 
 		 415 aa  87.4  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  27.16 
 
 		 426 aa  86.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  23.21 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  25.72 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  24.13 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  24.93 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  28.48 
 
 		 409 aa  83.2  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  27.54 
 
 		 423 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  26.51 
 
 		 437 aa  83.2  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  24.41 
 
 		 415 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  23.29 
 
 		 437 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  25.89 
 
 		 438 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  24.86 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  23.12 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  28.74 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  29.03 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  25.86 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  24.05 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  24.53 
 
 		 436 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  24.53 
 
 		 436 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  24.53 
 
 		 436 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  26.08 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  24.58 
 
 		 395 aa  79.7  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  28.89 
 
 		 949 aa  79  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  24.51 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  25.35 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  28.95 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  27.11 
 
 		 442 aa  76.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  29.95 
 
 		 414 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  25 
 
 		 437 aa  77  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  25.33 
 
 		 425 aa  76.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  25.07 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  26.59 
 
 		 412 aa  76.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  24.4 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  24.85 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  25.74 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  23.63 
 
 		 441 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>