200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0484 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 749 aa  1533    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  38.69 
 
 		 685 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 718 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 705 aa  347  4e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 705 aa  340  5e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 793 aa  183  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 766 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 780 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 713 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 708 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  24.67 
 
 		 701 aa  168  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 744 aa  167  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 713 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 713 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0965  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 773 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.195804  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 729 aa  160  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  24.36 
 
 		 708 aa  160  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 717 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 714 aa  158  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 758 aa  156  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 741 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 713 aa  150  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 713 aa  150  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 721 aa  150  9e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 769 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 713 aa  149  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 672 aa  144  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 716 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  29.05 
 
 		 772 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 750 aa  139  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 766 aa  137  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  22.95 
 
 		 775 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 767 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 760 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 697 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 713 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 681 aa  108  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  22.12 
 
 		 698 aa  103  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  21.9 
 
 		 725 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 673 aa  97.8  7e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  23.94 
 
 		 724 aa  97.4  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  21.66 
 
 		 696 aa  95.1  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  20.32 
 
 		 667 aa  90.9  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 668 aa  90.9  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  23.67 
 
 		 695 aa  88.6  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  21.6 
 
 		 710 aa  88.2  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  21.6 
 
 		 710 aa  88.2  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  21.6 
 
 		 710 aa  88.2  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  22.72 
 
 		 749 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  27.51 
 
 		 662 aa  87  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  22.72 
 
 		 749 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  26.36 
 
 		 699 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  22.01 
 
 		 745 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  22.12 
 
 		 745 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  22.12 
 
 		 745 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  22.12 
 
 		 745 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  21.39 
 
 		 753 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  24.64 
 
 		 687 aa  80.9  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 661 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  26.89 
 
 		 667 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3271  outer membrane heme receptor  22 
 
 		 728 aa  79.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403034  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  21.12 
 
 		 702 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 768 aa  77.8  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  27.95 
 
 		 691 aa  77  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  23.49 
 
 		 688 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  23.49 
 
 		 688 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 685 aa  75.5  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  23.15 
 
 		 688 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  23.4 
 
 		 723 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  20.21 
 
 		 702 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 627 aa  72.4  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  25.09 
 
 		 687 aa  71.6  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  24.44 
 
 		 668 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  22.82 
 
 		 688 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  24.44 
 
 		 668 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  25 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  23.02 
 
 		 719 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 698 aa  70.5  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  25.19 
 
 		 661 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 684 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  22.51 
 
 		 710 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  23.19 
 
 		 676 aa  66.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 668 aa  66.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  21.24 
 
 		 702 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  23.19 
 
 		 676 aa  66.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 727 aa  65.1  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 735 aa  64.7  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 821 aa  64.3  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  31.93 
 
 		 681 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 689 aa  63.5  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  24.27 
 
 		 687 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  24.18 
 
 		 726 aa  62  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  23.61 
 
 		 698 aa  62.4  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  31.09 
 
 		 681 aa  62  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  31.09 
 
 		 686 aa  62  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  24.27 
 
 		 709 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  25.51 
 
 		 684 aa  60.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  26.07 
 
 		 713 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 824 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 705 aa  59.3  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>