More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0404 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 		 373 aa  777    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.17 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  34.17 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.17 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  33.89 
 
 		 380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  34.72 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  34.17 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 		 382 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  33.61 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  33.61 
 
 		 380 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  33.61 
 
 		 380 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  33.61 
 
 		 380 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.61 
 
 		 382 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.61 
 
 		 382 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.44 
 
 		 385 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  33.06 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.06 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  34.36 
 
 		 662 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.15 
 
 		 381 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  33.61 
 
 		 379 aa  212  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.89 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.6 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.6 
 
 		 375 aa  207  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  32.04 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.42 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.79 
 
 		 361 aa  204  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.24 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.5 
 
 		 363 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  31.39 
 
 		 585 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.07 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.13 
 
 		 356 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  31.69 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  33.52 
 
 		 605 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  33.06 
 
 		 605 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.6 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.91 
 
 		 396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  31.48 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.28 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.03 
 
 		 366 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.51 
 
 		 388 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  31.28 
 
 		 366 aa  185  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.52 
 
 		 406 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.45 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  31.47 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.02 
 
 		 366 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.53 
 
 		 585 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  29.34 
 
 		 625 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.97 
 
 		 669 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  31.89 
 
 		 606 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  31.89 
 
 		 606 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  30.83 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.51 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  30.83 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  31.96 
 
 		 356 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.38 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.17 
 
 		 387 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  30.03 
 
 		 368 aa  179  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.89 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.83 
 
 		 367 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.58 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  29.76 
 
 		 365 aa  176  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  29.33 
 
 		 627 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.16 
 
 		 380 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.86 
 
 		 363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  31.38 
 
 		 365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.43 
 
 		 380 aa  173  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.86 
 
 		 702 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  30.25 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  30.52 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.55 
 
 		 407 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  27.1 
 
 		 670 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  27.98 
 
 		 597 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  29.63 
 
 		 358 aa  166  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.92 
 
 		 688 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  27.58 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  31.55 
 
 		 616 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.07 
 
 		 677 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.89 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.27 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.86 
 
 		 356 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.74 
 
 		 358 aa  153  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2893  ferredoxin  30.19 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200106  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  28.84 
 
 		 355 aa  150  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.53 
 
 		 675 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  28.81 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.1 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  27.95 
 
 		 372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  28.33 
 
 		 676 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5717  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.27 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  29.89 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0310  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.81 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.05 
 
 		 354 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  28.8 
 
 		 351 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  28.49 
 
 		 372 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  28.36 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0543  ferredoxin  29.14 
 
 		 339 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032188 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.48 
 
 		 342 aa  143  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  29.18 
 
 		 380 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1416  ferredoxin  27.75 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.74 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>