203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0287 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0287  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  758    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  32.58 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0005  metal dependent phosphohydrolase  30.31 
 
 		 354 aa  153  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  32.6 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0608223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  32.6 
 
 		 347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  33.61 
 
 		 266 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0007  putative signal transduction protein  32.23 
 
 		 347 aa  146  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000736166 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  30 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000619076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  29.39 
 
 		 346 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0005  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 		 350 aa  143  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0011  putative signal transduction protein  31.02 
 
 		 334 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000072807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0005  putative signal transduction protein  31.48 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373694  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0011  putative signal transduction protein  29.09 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  29.09 
 
 		 346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0013  putative signal transduction protein  29.82 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000360962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  25.51 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  25.51 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  25.51 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  26.53 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  24.24 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  22.44 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  24.12 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  24.37 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  22.45 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  22.12 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  30.34 
 
 		 730 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  19.75 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  23.74 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  28.37 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  20.11 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  22.28 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  24.12 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  21.78 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  22.16 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4397  putative signal transduction protein  26.02 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  21.72 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  24.03 
 
 		 912 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  23.53 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  20.56 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  24.7 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  22.88 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2952  putative signal transduction protein  25.53 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.281688  normal  0.0690285 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  23.33 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  27.27 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  22.89 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  23.62 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  23.62 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  23.62 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  24.08 
 
 		 467 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  24.8 
 
 		 467 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  21.78 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  23.62 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  20.98 
 
 		 280 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  25.64 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  22.75 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  25.69 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  24.39 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  23 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  23.12 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  23.3 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5560  signal transduction protein  24.26 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0162  putative signal transduction protein  24.62 
 
 		 467 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  23.15 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  21.78 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6123  hypothetical protein  23.38 
 
 		 469 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  21.61 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70580  hypothetical protein  23.38 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  21.99 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  21.3 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  21.99 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  20.92 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  24.61 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  23.74 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  23.32 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  22.11 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  22.11 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  23.32 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  24.81 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  27.32 
 
 		 716 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  22.69 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  22.39 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0200  hypothetical protein  21.39 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  20.5 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  22.96 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  22.02 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  20.73 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  20.69 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2515  putative signal transduction protein  25.41 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  25 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0032  putative signal transduction protein  28.97 
 
 		 345 aa  57  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  29.46 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  26.24 
 
 		 274 aa  57  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  23.9 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  22.11 
 
 		 505 aa  57  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  23.59 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  20.56 
 
 		 718 aa  56.2  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  21.82 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  25.53 
 
 		 276 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>