52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0266 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1178    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  28.79 
 
 		 448 aa  109  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  29.75 
 
 		 526 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  26.4 
 
 		 450 aa  104  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  30.66 
 
 		 469 aa  103  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  26.92 
 
 		 464 aa  100  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  28.05 
 
 		 470 aa  94.7  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  27.87 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  25.07 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  26.32 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  28.42 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  26.74 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  23.73 
 
 		 559 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  27.72 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  25.96 
 
 		 499 aa  77  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  27.68 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  26.37 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  25.93 
 
 		 462 aa  73.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  27.56 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  27.64 
 
 		 452 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  22.44 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  25 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  24.73 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  27.17 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2230  phosphate-selective porin O and P  26.04 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  25.45 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  26.37 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  25.6 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  25.44 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  24.91 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  25.44 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  25.68 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  22.49 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  24.91 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  25 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  23.3 
 
 		 414 aa  56.2  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3882  phosphate-selective porin O and P  26.53 
 
 		 357 aa  55.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1375  hypothetical protein  23.3 
 
 		 610 aa  54.7  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3355  phosphate-selective porin O and P  32.84 
 
 		 397 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.277566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1451  phosphate-selective porin O and P  23.28 
 
 		 560 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.757394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  23.88 
 
 		 391 aa  52.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0900  hypothetical protein  21.04 
 
 		 539 aa  51.2  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  24.1 
 
 		 389 aa  51.2  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0256  phosphate-selective porin O and P  23.66 
 
 		 398 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  22.83 
 
 		 389 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0285  porin O precursor  24.09 
 
 		 398 aa  50.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  31.54 
 
 		 435 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  31.54 
 
 		 435 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  31.54 
 
 		 429 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  31.54 
 
 		 435 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02409  porin O  25 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3875  phosphate-selective porin-like  22.13 
 
 		 376 aa  44.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>