180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0142 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  100 
 
 
175 aa  361  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  74.29 
 
 
175 aa  278  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  74.29 
 
 
175 aa  279  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  76.47 
 
 
181 aa  274  5e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  71.84 
 
 
178 aa  270  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  71.84 
 
 
178 aa  270  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  71.84 
 
 
178 aa  270  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  71.84 
 
 
178 aa  268  3e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  72.94 
 
 
178 aa  267  6e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  72.94 
 
 
178 aa  267  6e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  72.94 
 
 
178 aa  267  6e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  72.94 
 
 
178 aa  267  6e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  72.94 
 
 
175 aa  266  7e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  71.26 
 
 
178 aa  266  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  70.52 
 
 
175 aa  265  3e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  70.18 
 
 
174 aa  264  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  70.18 
 
 
175 aa  262  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  1.21988e-08 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  69.14 
 
 
175 aa  263  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  70.11 
 
 
175 aa  256  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  68.45 
 
 
169 aa  248  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  68.45 
 
 
169 aa  248  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  68.45 
 
 
169 aa  248  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  66.67 
 
 
172 aa  245  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  63.69 
 
 
169 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  63.1 
 
 
168 aa  234  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  63.1 
 
 
168 aa  234  5e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  65.43 
 
 
166 aa  231  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  66.67 
 
 
165 aa  230  9e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  61.49 
 
 
165 aa  216  9e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  61.49 
 
 
165 aa  216  9e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  61.49 
 
 
165 aa  216  9e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  4.82664e-05 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  61.49 
 
 
165 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.46321e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  61.49 
 
 
165 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  4.65713e-11 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01873  ferritin iron storage protein (cytoplasmic)  61.49 
 
 
165 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00913227  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  61.49 
 
 
165 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  61.49 
 
 
165 aa  216  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.4289e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2138  ferritin  61.49 
 
 
165 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000244733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2644  ferritin  61.49 
 
 
165 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  4.90475e-09 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0920  ferritin like protein 1  58.39 
 
 
161 aa  215  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0864948  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  61.49 
 
 
165 aa  216  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  1.16181e-05 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1731  ferritin  61.49 
 
 
165 aa  216  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0712899  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  61.49 
 
 
165 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1031  ferritin  60.87 
 
 
165 aa  213  2e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000984451  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2486  ferritin  60.25 
 
 
165 aa  210  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  55.43 
 
 
175 aa  205  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0308  ferritin  50 
 
 
162 aa  179  2e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.25083  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  50 
 
 
167 aa  171  6e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  49.38 
 
 
167 aa  169  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  49.38 
 
 
167 aa  169  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  49.07 
 
 
164 aa  166  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  48.67 
 
 
166 aa  158  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  41.42 
 
 
172 aa  143  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  42.5 
 
 
170 aa  138  4e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  42.77 
 
 
173 aa  132  2e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  44.38 
 
 
169 aa  132  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2797  Ferritin Dps family protein  39.76 
 
 
176 aa  130  7e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  40.48 
 
 
171 aa  129  2e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  40.88 
 
 
171 aa  127  8e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  38.41 
 
 
168 aa  126  2e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.92038e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  41.51 
 
 
165 aa  125  2e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  38.36 
 
 
176 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  6.24545e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2792  Ferritin Dps family protein  41.98 
 
 
171 aa  123  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0380  hypothetical protein  38.82 
 
 
175 aa  122  3e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  39.62 
 
 
172 aa  119  1e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  39.62 
 
 
176 aa  119  2e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  39.62 
 
 
172 aa  119  2e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.48628e-10 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  39.63 
 
 
171 aa  119  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  2.23127e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  38.12 
 
 
173 aa  118  4e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  2.53889e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  38.99 
 
 
168 aa  118  4e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  3.23257e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  37.95 
 
 
175 aa  118  5e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  36.53 
 
 
171 aa  117  9e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  35.62 
 
 
173 aa  116  2e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  2.65061e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  40.25 
 
 
164 aa  115  2e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  35.71 
 
 
171 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  35.71 
 
 
170 aa  115  4e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  7.20561e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  35.09 
 
 
175 aa  114  8e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  36.88 
 
 
177 aa  114  9e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  35.12 
 
 
170 aa  113  1e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  2.19081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  39.88 
 
 
169 aa  113  1e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1313  ferritin  39.24 
 
 
167 aa  113  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79199e-14 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2087  ferritin  39.24 
 
 
167 aa  113  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  1.11802e-05 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1189  ferritin, Dps family protein  39.24 
 
 
167 aa  113  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000117552  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2147  ferritin  39.24 
 
 
167 aa  113  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  4.77391e-21 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2093  ferritin, Dps family protein  39.24 
 
 
167 aa  113  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.991822  hitchhiker  3.99578e-21 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  39.38 
 
 
162 aa  113  2e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  36.9 
 
 
166 aa  113  2e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  34.73 
 
 
175 aa  112  2e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2638  ferritin family protein  39.76 
 
 
167 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  3.60651e-11 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  37.5 
 
 
162 aa  112  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1741  Ferritin Dps family protein  39.16 
 
 
167 aa  111  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861271  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1283  ferritin family protein  39.16 
 
 
167 aa  111  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0356049  hitchhiker  2.38021e-06 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01870  predicted ferritin-like protein  39.16 
 
 
167 aa  111  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0471958  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1733  Ferritin Dps family protein  39.16 
 
 
167 aa  111  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2133  ferritin family protein  39.16 
 
 
167 aa  111  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00478482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01859  hypothetical protein  39.16 
 
 
167 aa  111  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0419737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1998  ferritin family protein  39.16 
 
 
167 aa  111  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000718923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  35 
 
 
174 aa  111  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.56866e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  35.85 
 
 
164 aa  110  7e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  37.97 
 
 
168 aa  110  1e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  37.97 
 
 
168 aa  110  1e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.0835e-10  hitchhiker  1.91654e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>