40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0090 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0090  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1047  NADPH-dependent FMN reductase  58.1 
 
 
210 aa  251  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.418607  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0887  NADPH-dependent FMN reductase  56.67 
 
 
202 aa  240  9e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0994  NADPH-dependent FMN reductase  55.05 
 
 
218 aa  236  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0914  NADPH-dependent FMN reductase  51.9 
 
 
201 aa  222  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2999  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
204 aa  207  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930809  normal  0.251382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3080  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
204 aa  207  7e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0693742  normal  0.504641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3585  azoreductase, putative  50 
 
 
204 aa  207  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3177  NADPH-dependent FMN reductase  49.54 
 
 
204 aa  206  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1079  NADPH-dependent FMN reductase  49.07 
 
 
204 aa  205  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1017  NADPH-dependent FMN reductase  49.54 
 
 
204 aa  205  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3279  NADPH-dependent FMN reductase  48.61 
 
 
204 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.097942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1010  NADPH-dependent FMN reductase  48.61 
 
 
204 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1112  NADPH-dependent FMN reductase  48.61 
 
 
204 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2787  azoreductase, putative  42.38 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1997  NADPH-dependent FMN reductase  36.95 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.88361  normal  0.0341206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0985  NADPH-dependent FMN reductase  34.11 
 
 
202 aa  131  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0067  putative oxidoreductase  32.38 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2276  azoreductase  28.86 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.39855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2122  azoreductase  28.86 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.120348  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  28.86 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  30.37 
 
 
178 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  30.37 
 
 
178 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  28.19 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  28.19 
 
 
179 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2302  azoreductase  28.19 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00698178 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  26.85 
 
 
178 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  30.37 
 
 
178 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  28.19 
 
 
178 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  26.17 
 
 
176 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  26.49 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  28.93 
 
 
178 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  28.93 
 
 
178 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  26.37 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0597  hypothetical protein  30.3 
 
 
188 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0583  hypothetical protein  30.3 
 
 
188 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.600123  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  24.37 
 
 
186 aa  42.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  29.66 
 
 
181 aa  42  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  31.15 
 
 
192 aa  41.6  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00481  putative reductase  29.35 
 
 
174 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.543235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>