More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0067 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 726 aa  1490    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1344  TonB-dependent receptor  44.7 
 
 		 687 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341297  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  39.89 
 
 		 730 aa  513  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02805  TonB-dependent receptor  39.47 
 
 		 696 aa  510  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00354555  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  38.76 
 
 		 757 aa  511  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  39.35 
 
 		 713 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  38.36 
 
 		 748 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  39.52 
 
 		 714 aa  501  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  38.94 
 
 		 712 aa  498  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  37.75 
 
 		 733 aa  498  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  38.23 
 
 		 736 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  40.11 
 
 		 743 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  39.06 
 
 		 732 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  40.26 
 
 		 744 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  39.83 
 
 		 744 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 		 729 aa  488  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  39.83 
 
 		 743 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  40.2 
 
 		 733 aa  477  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  39.69 
 
 		 729 aa  479  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  37.12 
 
 		 744 aa  465  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  36.48 
 
 		 697 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 764 aa  204  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 704 aa  188  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 720 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.55 
 
 		 715 aa  177  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 720 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 729 aa  174  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 690 aa  173  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 733 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 690 aa  170  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 687 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 762 aa  165  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 728 aa  164  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 783 aa  163  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 767 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 728 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 779 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 755 aa  159  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 759 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 771 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 730 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 731 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 853 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 758 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 761 aa  154  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 773 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 803 aa  154  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 686 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 851 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 790 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 771 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 695 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 773 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 773 aa  151  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 695 aa  151  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 751 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 702 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 759 aa  149  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 808 aa  147  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 758 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 694 aa  146  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 731 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 726 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.03 
 
 		 755 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 784 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 713 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 758 aa  144  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 718 aa  144  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 743 aa  143  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 758 aa  144  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 774 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 732 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 753 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 761 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 777 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 741 aa  140  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 758 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 767 aa  138  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 778 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 802 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 767 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 759 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 700 aa  137  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 873 aa  137  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 723 aa  137  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 737 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 694 aa  136  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 732 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 747 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  37.56 
 
 		 798 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 719 aa  135  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 766 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 778 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 790 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 769 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 771 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 792 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 777 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 787 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 666 aa  133  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>