164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0007 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0007  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  213  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1266  dnaK suppressor protein  40.62 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1803  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488445  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1477  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0166  DnaK suppressor protein  40.43 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1800  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40860  hypothetical protein  37.5 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.802206  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0973  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.5 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492217  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 104 aa  67  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.48 
 
 		 114 aa  67  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0812  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1198  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  43.48 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1430  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0916  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354828  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0604  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2698  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2791  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.16 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2884  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.16 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.17875  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16480  DnaK suppressor protein  35.58 
 
 		 236 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266038  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.76 
 
 		 213 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  31 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.414377  normal  0.0706919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0680  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0997736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1697  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 234 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.389898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1858  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.663069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.1 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4875  hypothetical protein  47.27 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1427  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0733302  normal  0.617985 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 119 aa  50.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.581103  normal  0.0182397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1351  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 212 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2760  DnaK suppressor protein  34.31 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.19847e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0100  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3596  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.94 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  41.3 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0167  putative DnaK suppressor  34.78 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000243735  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3073  transcriptional regulator, TraR/DksA family protein  51.22 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1184  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000422996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1290  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4024  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.07 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60560  hypothetical protein  45.07 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.654182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.35 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.35 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.84 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  47.83 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3208  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.58 
 
 		 218 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000145805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5217  hypothetical protein  45.07 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  40 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2062  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.89 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000865725 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  37.66 
 
 		 283 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.9 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  27.84 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3895  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.05 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0249902  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1363  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.67 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000285999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1324  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820819  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4453  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.142377 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  47.73 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.5 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2925  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3660  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1171  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2535  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.43 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.74 
 
 		 228 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3489  hypothetical protein  30.61 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.711789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2631  transcriptional regulator, TraR/DksA family  27.59 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0800447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0129  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1413  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.84 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0401  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.62 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000019993  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.22 
 
 		 210 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  32.86 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4329  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.18 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1204  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.418656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0964  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.633657  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2555  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0212  conserved hypothetical protein, DksA-like protein  39.22 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  44.19 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2444  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  30.93 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1267  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 258 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0615  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1282  zinc finger DksA/TraR C4-type  45.45 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1977  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3190  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.25 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4387  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 256 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1373  dnaK suppressor protein, putative  48.65 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000567795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1158  hypothetical protein  32.31 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1154  DnaK suppressor protein-like protein  48.65 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0866  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 251 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1504  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000779378  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3641  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2860  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.38 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>