131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_C0015 on replicon NC_008265
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  100 
 
 
581 aa  1189    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  57.74 
 
 
571 aa  680    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  37.82 
 
 
572 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  37.44 
 
 
566 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  35.06 
 
 
579 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  36.25 
 
 
564 aa  339  8e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  33.33 
 
 
565 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  34.12 
 
 
565 aa  279  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  30.39 
 
 
569 aa  263  4e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  30.3 
 
 
556 aa  263  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  31.61 
 
 
581 aa  261  3e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  31.61 
 
 
577 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  31.75 
 
 
574 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  32.12 
 
 
557 aa  252  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  31.43 
 
 
577 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  30.32 
 
 
590 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  30.32 
 
 
562 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  31.35 
 
 
573 aa  248  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  30.14 
 
 
591 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  31.23 
 
 
590 aa  240  4e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  31.23 
 
 
590 aa  240  4e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  31.23 
 
 
590 aa  240  4e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  29.96 
 
 
552 aa  240  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  30.38 
 
 
564 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  29.81 
 
 
602 aa  230  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  30.63 
 
 
568 aa  229  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  30.7 
 
 
558 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  29.19 
 
 
561 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  29.19 
 
 
569 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  30.47 
 
 
563 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  30.47 
 
 
563 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  30.5 
 
 
581 aa  223  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  28.45 
 
 
581 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  28.87 
 
 
581 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  28.69 
 
 
581 aa  217  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  30.47 
 
 
565 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  29.57 
 
 
585 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  29.2 
 
 
586 aa  210  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  29.66 
 
 
583 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  29.53 
 
 
541 aa  207  3e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  26.48 
 
 
546 aa  206  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  28.37 
 
 
553 aa  203  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  30.89 
 
 
535 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  29.37 
 
 
543 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  27.09 
 
 
562 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  27.09 
 
 
562 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  28.01 
 
 
562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  28.01 
 
 
562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  30.14 
 
 
550 aa  199  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  28.06 
 
 
535 aa  198  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  26.8 
 
 
562 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  28.46 
 
 
534 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  28.73 
 
 
563 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  28.27 
 
 
534 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  26.66 
 
 
561 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  29.24 
 
 
588 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  28.04 
 
 
604 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  27.05 
 
 
521 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  27.45 
 
 
574 aa  174  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1117  phage terminase  25.39 
 
 
629 aa  164  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  26.69 
 
 
602 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  23.76 
 
 
545 aa  163  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  23.37 
 
 
530 aa  156  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  27.39 
 
 
849 aa  156  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  25.12 
 
 
593 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  29.74 
 
 
455 aa  151  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1649  Phage terminase-like protein, large subunit  25.08 
 
 
626 aa  146  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  23.62 
 
 
561 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  24.8 
 
 
606 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  24.8 
 
 
606 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  24.27 
 
 
540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  24.12 
 
 
510 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  23.9 
 
 
611 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  25.28 
 
 
555 aa  123  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  22.59 
 
 
584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  47.22 
 
 
163 aa  121  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  24.69 
 
 
556 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  25.77 
 
 
491 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  24.81 
 
 
528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  23.66 
 
 
540 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  22.35 
 
 
537 aa  114  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  22.16 
 
 
537 aa  114  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  24.77 
 
 
529 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  22.2 
 
 
542 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  22.6 
 
 
542 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4976  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  26.19 
 
 
525 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5356  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  26.19 
 
 
523 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  23.99 
 
 
498 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  30.57 
 
 
215 aa  100  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  24.93 
 
 
356 aa  100  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  28.15 
 
 
229 aa  99.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  21.58 
 
 
535 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  24.57 
 
 
570 aa  98.2  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1603  Terminase  23.65 
 
 
557 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  20.84 
 
 
535 aa  98.2  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  23.72 
 
 
546 aa  95.5  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  22.34 
 
 
580 aa  94  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  23.75 
 
 
629 aa  92  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  23.45 
 
 
555 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  23.74 
 
 
503 aa  87.4  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>