13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_B0010 on replicon NC_008264
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008264  CPR_B0010  replication protein  100 
 
 		 406 aa  820    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.700386  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0633  replication protein  94.19 
 
 		 368 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3466  replication protein  42.82 
 
 		 437 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.255263  normal  0.875759 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3576  replication protein  41.76 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2958  replication protein  32.93 
 
 		 428 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2317  response regulator receiver protein  31.44 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2165  hypothetical protein  30.62 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00029385  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3471  replication protein  33.23 
 
 		 448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.819035  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0139  hypothetical protein  25.81 
 
 		 632 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2637  hypothetical protein  26.91 
 
 		 591 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  30.65 
 
 		 978 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2569  virulence-associated E  23.57 
 
 		 697 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00313413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3238  hypothetical protein  25.61 
 
 		 947 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0772641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>