More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2661 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  99.22 
 
 
386 aa  779    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 
386 aa  785    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  46.23 
 
 
382 aa  353  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  43.19 
 
 
380 aa  345  8e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  44.76 
 
 
382 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  42.41 
 
 
381 aa  335  9e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  43.08 
 
 
380 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  39.79 
 
 
381 aa  332  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  39.47 
 
 
385 aa  324  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  39.16 
 
 
380 aa  323  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  40.79 
 
 
383 aa  321  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  43.8 
 
 
381 aa  318  7.999999999999999e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  38.48 
 
 
380 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  40.89 
 
 
385 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  38.58 
 
 
381 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  39.89 
 
 
383 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  45.6 
 
 
381 aa  308  8e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  37.8 
 
 
380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  39.84 
 
 
387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  41.69 
 
 
379 aa  306  3e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  37.24 
 
 
380 aa  306  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  40.53 
 
 
383 aa  302  7.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  38.26 
 
 
388 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  40.63 
 
 
384 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  38.24 
 
 
400 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  38.26 
 
 
381 aa  290  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  37.7 
 
 
398 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  36.39 
 
 
385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  41.47 
 
 
378 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  39.53 
 
 
388 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  39.89 
 
 
381 aa  276  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  35.88 
 
 
380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  38.7 
 
 
390 aa  265  7e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  38.22 
 
 
382 aa  264  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  34.16 
 
 
413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  37.63 
 
 
376 aa  252  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  35.5 
 
 
379 aa  252  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  36.48 
 
 
388 aa  251  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  32.99 
 
 
392 aa  249  8e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  36.81 
 
 
383 aa  239  5e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  36.13 
 
 
386 aa  236  6e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  33.95 
 
 
378 aa  230  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  33.68 
 
 
392 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  31.05 
 
 
380 aa  218  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.32 
 
 
412 aa  209  5e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  31.32 
 
 
376 aa  207  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  32.55 
 
 
393 aa  200  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.63 
 
 
417 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  31.69 
 
 
408 aa  193  4e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.73 
 
 
409 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.55 
 
 
406 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  29.35 
 
 
896 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.17 
 
 
425 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.5 
 
 
412 aa  189  9e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  30.15 
 
 
403 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.51 
 
 
415 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.99 
 
 
406 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.89 
 
 
406 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  31.69 
 
 
393 aa  186  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  29.95 
 
 
394 aa  186  8e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  30.21 
 
 
395 aa  185  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  29.72 
 
 
393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  30.23 
 
 
421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  32.81 
 
 
405 aa  182  6e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  32.63 
 
 
406 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  32.63 
 
 
406 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  32.63 
 
 
406 aa  182  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  32.37 
 
 
406 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  32.37 
 
 
406 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  32.37 
 
 
406 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  32.37 
 
 
406 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  32.37 
 
 
406 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.47 
 
 
416 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  32.63 
 
 
406 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  29.23 
 
 
394 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  31.25 
 
 
879 aa  180  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.99 
 
 
406 aa  180  4.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  29.61 
 
 
880 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  30.85 
 
 
420 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  30.18 
 
 
423 aa  179  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.11 
 
 
414 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.41 
 
 
406 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.01 
 
 
418 aa  176  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.32 
 
 
428 aa  176  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.23 
 
 
572 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.7 
 
 
644 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.62 
 
 
419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.57 
 
 
885 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  29.56 
 
 
417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.62 
 
 
419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.41 
 
 
414 aa  172  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.03 
 
 
420 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  32.75 
 
 
422 aa  172  1e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  27.57 
 
 
425 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  29.87 
 
 
626 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.51 
 
 
415 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.72 
 
 
414 aa  171  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  27.72 
 
 
878 aa  170  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  27.41 
 
 
424 aa  170  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.03 
 
 
418 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>