More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2650 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
148 aa  291  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
148 aa  291  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  55.17 
 
 
148 aa  150  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  55.17 
 
 
148 aa  148  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 
148 aa  134  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  49.66 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  47.97 
 
 
146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  48.3 
 
 
147 aa  124  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  52.74 
 
 
149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.84 
 
 
150 aa  123  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  44.22 
 
 
148 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  43.45 
 
 
148 aa  121  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 
148 aa  121  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  49.32 
 
 
147 aa  120  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  44.83 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  47.59 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  37.93 
 
 
174 aa  114  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  37.58 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 
148 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
147 aa  110  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  40.14 
 
 
159 aa  110  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  52.41 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  38.62 
 
 
149 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 
149 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  41.1 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 
148 aa  106  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
150 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 
149 aa  106  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
148 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
148 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  37.93 
 
 
151 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
151 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 
151 aa  103  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  38.3 
 
 
151 aa  104  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 
152 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5913  ribosomal protein L9  40.69 
 
 
150 aa  103  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 
147 aa  103  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 
147 aa  103  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 
160 aa  103  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2135  ribosomal protein L9  42.86 
 
 
148 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
148 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  35.86 
 
 
149 aa  102  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 
148 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 
148 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  34.25 
 
 
148 aa  101  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  40 
 
 
147 aa  101  4e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
148 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
148 aa  100  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
148 aa  100  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
148 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
148 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  35.86 
 
 
157 aa  101  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 
150 aa  100  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 
151 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  38.69 
 
 
150 aa  100  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  32.19 
 
 
151 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2006  ribosomal protein L9  39.46 
 
 
152 aa  99.4  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  36.55 
 
 
178 aa  99  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  36.67 
 
 
171 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
146 aa  97.4  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
151 aa  97.4  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  41.72 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  35.62 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  45.89 
 
 
147 aa  97.1  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  32.41 
 
 
148 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  35.46 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  35.86 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  33.1 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  32.88 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 
165 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0112  50S ribosomal protein L9  40.56 
 
 
173 aa  94.7  4e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 
151 aa  94  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  35.17 
 
 
151 aa  94  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  36.67 
 
 
191 aa  94  7e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  36.67 
 
 
168 aa  93.6  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 
149 aa  93.6  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1966  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1675  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
199 aa  92.8  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000107335  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  33.1 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  34.01 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0740  ribosomal protein L9  37.16 
 
 
150 aa  92  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  35.17 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  34.93 
 
 
151 aa  92  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1375  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0636184  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 
151 aa  92  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3781  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>