40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2619 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2619  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  277  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2936  hypothetical protein  98.6 
 
 
143 aa  273  7e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1952  hypothetical protein  45.52 
 
 
145 aa  118  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00709257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0867  protein of unknown function DUF606  36.43 
 
 
144 aa  106  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2418  hypothetical protein  36.69 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2367  hypothetical protein  35.97 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2965  hypothetical protein  35.97 
 
 
141 aa  94  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108015  normal  0.0601681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2211  hypothetical protein  34.53 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.309526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2369  hypothetical protein  36.43 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2963  hypothetical protein  37.14 
 
 
156 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.41688  normal  0.045431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2213  hypothetical protein  35 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  33.09 
 
 
147 aa  84.3  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2420  hypothetical protein  35 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  37.88 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  31.85 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  32.84 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  33.59 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  29.77 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  30.33 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  25.56 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  25.56 
 
 
149 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  25.56 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  27.07 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  25.56 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0688  hypothetical protein  28.99 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.32062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  29.41 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1408  hypothetical protein  28.26 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  27.66 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1268  hypothetical protein  28.99 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  24.03 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  27.12 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  27.87 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  25.21 
 
 
160 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  26.05 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  23.66 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  27.21 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  28.28 
 
 
307 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  24.82 
 
 
137 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  24.65 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  26.24 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>