More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2579 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2900  [Fe] hydrogenase  98.16 
 
 
490 aa  964    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2579  [Fe] hydrogenase  100 
 
 
490 aa  984    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0836  hydrogenase large subunit domain protein  51.35 
 
 
482 aa  491  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000619385  hitchhiker  0.000460922 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0750  hydrogenase large subunit  49.48 
 
 
482 aa  466  9.999999999999999e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0180769  hitchhiker  0.000000000087178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  43.51 
 
 
484 aa  388  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  40.75 
 
 
507 aa  363  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  41.54 
 
 
488 aa  360  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1794  hydrogenase large subunit  43.89 
 
 
462 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0413  hydrogenase large subunit  40.25 
 
 
485 aa  332  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0146308  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0725  hydrogenase-like  37.29 
 
 
483 aa  322  7e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000665726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0996  hydrogenase large subunit domain protein  40.5 
 
 
454 aa  316  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000195829  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  39.7 
 
 
478 aa  311  2e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0411  Ferredoxin hydrogenase  41.04 
 
 
531 aa  310  2.9999999999999997e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0687694  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02090  hydrogenase large subunit domain protein  38.46 
 
 
491 aa  300  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  38.88 
 
 
493 aa  298  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  35.14 
 
 
508 aa  291  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2631  Ferredoxin hydrogenase  36.63 
 
 
490 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000219307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02870  Ferredoxin hydrogenase  41.94 
 
 
456 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.417058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1708  hydrogenase large subunit domain protein  36.64 
 
 
435 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1440  hydrogenase large subunit  39.06 
 
 
429 aa  181  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0813  hydrogenase large subunit domain protein  36.21 
 
 
424 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.128167  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0261  hydrogenase subunit (ferredoxin)  36.96 
 
 
449 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.578609  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0270  [Fe] hydrogenase  36.63 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1713  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.39 
 
 
748 aa  167  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000552259  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0655  putative PAS/PAC sensor protein  34.18 
 
 
580 aa  160  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  32.89 
 
 
566 aa  157  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02060  putative PAS/PAC sensor protein  33.02 
 
 
571 aa  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0839  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
569 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192903 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0752  putative PAS/PAC sensor protein  33.75 
 
 
559 aa  148  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.801139  hitchhiker  0.0000000000202467 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  30.57 
 
 
572 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  32.01 
 
 
1150 aa  147  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  29.82 
 
 
567 aa  146  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  30.03 
 
 
667 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  31.04 
 
 
653 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1889  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.56 
 
 
752 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  30.31 
 
 
572 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0426  putative PAS/PAC sensor protein  33.91 
 
 
556 aa  143  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  31.76 
 
 
562 aa  143  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1833  ferredoxin 2  33.02 
 
 
583 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00530052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  32.92 
 
 
644 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1585  putative PAS/PAC sensor protein  33.23 
 
 
573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000290099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0092  putative PAS/PAC sensor protein  34.47 
 
 
577 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0723  hydrogenase, Fe-only  31.72 
 
 
578 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1846  putative PAS/PAC sensor protein  31.87 
 
 
572 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  31.49 
 
 
645 aa  140  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  31.49 
 
 
645 aa  140  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2300  putative PAS/PAC sensor protein  30.45 
 
 
574 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.252887  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  30.47 
 
 
581 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  30.07 
 
 
601 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  29.57 
 
 
410 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  30.92 
 
 
582 aa  136  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  30.17 
 
 
410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3463  putative PAS/PAC sensor protein  32.77 
 
 
576 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  28.31 
 
 
439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  30.17 
 
 
410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0467  transcriptional regulator, Fis family  29.88 
 
 
767 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0318  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.04 
 
 
550 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  31.02 
 
 
570 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  33.33 
 
 
666 aa  131  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0055  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.9 
 
 
756 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.928801 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3601  hydrogenase, Fe-only  30.06 
 
 
587 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  30.59 
 
 
577 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  30.59 
 
 
615 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4176  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.54 
 
 
755 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000648689  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0625  hydrogenase, Fe-only  30.63 
 
 
587 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000144729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  32.13 
 
 
659 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  29.03 
 
 
574 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1149  hydrogenase, Fe-only  34.74 
 
 
569 aa  127  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000253121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  28.5 
 
 
594 aa  126  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  29.24 
 
 
417 aa  126  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3363  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.41 
 
 
763 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  31.58 
 
 
582 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  30.75 
 
 
644 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  30.95 
 
 
421 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  29.02 
 
 
582 aa  124  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0556  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.77 
 
 
542 aa  124  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  29.14 
 
 
527 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  29.12 
 
 
387 aa  123  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  31.63 
 
 
596 aa  123  9e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0747  hydrogenase, Fe-only  32.65 
 
 
582 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0723  hydrogenase, Fe-only  32.65 
 
 
582 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  32.17 
 
 
593 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  30.29 
 
 
586 aa  122  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  30.58 
 
 
583 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01770  putative PAS/PAC sensor protein  29.97 
 
 
584 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  26.47 
 
 
582 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3829  hydrogenase, Fe-only  29.41 
 
 
625 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2145  Fe-S cluster domain-containing protein  28.65 
 
 
435 aa  120  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0533  hydrogenase, Fe-only  29.26 
 
 
582 aa  120  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0310904  normal  0.240554 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  32.32 
 
 
580 aa  119  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1337  hydrogenase, Fe-only  32.4 
 
 
590 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  30 
 
 
573 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2502  iron-containing hydrogenase, Hyd gamma  29.97 
 
 
598 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1605  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  29.7 
 
 
585 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1544  hydrogenase, Fe-only  29.33 
 
 
581 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0463  hydrogenases, Fe-only  28.4 
 
 
520 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  28.3 
 
 
582 aa  118  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1717  Iron hydrogenase, small subunit  31.56 
 
 
573 aa  118  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.118526  normal  0.410336 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  29.79 
 
 
579 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0290  hydrogenase, Fe-only  26.81 
 
 
549 aa  117  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>