More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2546 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  100 
 
 
230 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2861  membrane protein  96.96 
 
 
230 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.563665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1218  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.29 
 
 
233 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  35.68 
 
 
228 aa  145  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.09 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.82 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0151  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.48 
 
 
228 aa  131  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0516  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.12 
 
 
228 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1879  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.92 
 
 
228 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2782  hypothetical protein  29.22 
 
 
235 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143596  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0628  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.77 
 
 
243 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517911  decreased coverage  0.00174403 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1909  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.07 
 
 
234 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00531601  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.46 
 
 
246 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3483  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.88 
 
 
235 aa  98.6  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.220694 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0551  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.03 
 
 
223 aa  98.2  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000556643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2887  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.02 
 
 
236 aa  96.7  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3605  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.41 
 
 
225 aa  95.5  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3675  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.85 
 
 
249 aa  95.9  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 
246 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 
246 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.71 
 
 
253 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4999  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.34 
 
 
244 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0989  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.19 
 
 
246 aa  85.1  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.23416  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18581  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.19 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.38 
 
 
610 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4058  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.44 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  28.65 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.87 
 
 
613 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.35 
 
 
604 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.87 
 
 
613 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.91 
 
 
789 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.87 
 
 
613 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.04 
 
 
628 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.87 
 
 
619 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1715  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  36.02 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0270352  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_54791  biogenesis protein  25 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4015  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.02 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16381  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.64 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0473  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.96 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.35 
 
 
619 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.35 
 
 
619 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.35 
 
 
619 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1088  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.36 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16491  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.57 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.87 
 
 
608 aa  79  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.35 
 
 
609 aa  79  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1026  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.36 
 
 
232 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  29.22 
 
 
630 aa  78.2  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.63 
 
 
752 aa  77.8  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.84 
 
 
611 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.84 
 
 
610 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0323  cytochrome c biogenesis protein-like  28.57 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.04 
 
 
602 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.25 
 
 
631 aa  76.3  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  25.53 
 
 
750 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  29.29 
 
 
623 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16611  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  28.04 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.67 
 
 
607 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.63 
 
 
570 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  27.63 
 
 
586 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10432  predicted protein  31.28 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000896469  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  27.19 
 
 
586 aa  73.2  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.77 
 
 
624 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  30.95 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.59 
 
 
583 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2203  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.08 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.31 
 
 
624 aa  72.4  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.17 
 
 
592 aa  72  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.5 
 
 
466 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  24.74 
 
 
449 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.78 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.17 
 
 
592 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.89 
 
 
572 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.61 
 
 
810 aa  69.7  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.63 
 
 
595 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1552  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.67 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.63 
 
 
595 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.81 
 
 
561 aa  69.7  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.63 
 
 
595 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  27.23 
 
 
618 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.41 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.965188  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.11 
 
 
567 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.52 
 
 
624 aa  68.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  25.26 
 
 
449 aa  68.6  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.11 
 
 
567 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.11 
 
 
567 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.75 
 
 
583 aa  68.6  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.11 
 
 
567 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.11 
 
 
567 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.82 
 
 
565 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.82 
 
 
565 aa  68.6  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.82 
 
 
565 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  28.82 
 
 
565 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.82 
 
 
565 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.82 
 
 
565 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.82 
 
 
565 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.81 
 
 
565 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  28.82 
 
 
565 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2278  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.63 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.800011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>