More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2544 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  99.12 
 
 		 455 aa  882    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  100 
 
 		 455 aa  887    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  48.88 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  47.99 
 
 		 456 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  44.77 
 
 		 449 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  41.04 
 
 		 455 aa  348  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  44.62 
 
 		 454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  43.2 
 
 		 455 aa  338  9.999999999999999e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  40.58 
 
 		 455 aa  330  4e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  40.68 
 
 		 477 aa  327  3e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  40.68 
 
 		 454 aa  316  5e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  39.55 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  39.9 
 
 		 451 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  39.34 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  39.5 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  38.07 
 
 		 442 aa  300  5e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  39.34 
 
 		 464 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  39.34 
 
 		 447 aa  296  4e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  40.19 
 
 		 449 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  40.49 
 
 		 461 aa  293  4e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  35.73 
 
 		 455 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  36.81 
 
 		 448 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  41.94 
 
 		 466 aa  281  1e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  41.34 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  36.44 
 
 		 452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  34.71 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  36.56 
 
 		 493 aa  270  5e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  31.97 
 
 		 466 aa  257  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  35.11 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  34.62 
 
 		 466 aa  250  4e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  34 
 
 		 454 aa  249  7e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  35.23 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  36.16 
 
 		 456 aa  247  4e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  36.14 
 
 		 461 aa  247  4e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  36.26 
 
 		 470 aa  244  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  36.55 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  34.21 
 
 		 450 aa  239  8e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  30.94 
 
 		 496 aa  239  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  31.76 
 
 		 467 aa  230  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  32.96 
 
 		 447 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  30.77 
 
 		 446 aa  229  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  30.99 
 
 		 448 aa  229  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  30.13 
 
 		 448 aa  229  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  31.6 
 
 		 451 aa  229  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  32.48 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  31.56 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  32.29 
 
 		 452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  30.51 
 
 		 496 aa  220  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  30.35 
 
 		 452 aa  219  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  30.22 
 
 		 451 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  30 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  32.23 
 
 		 450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  32.23 
 
 		 450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  31.99 
 
 		 448 aa  217  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  31.95 
 
 		 458 aa  216  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  32.35 
 
 		 451 aa  216  5.9999999999999996e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  30.89 
 
 		 443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  31.84 
 
 		 450 aa  213  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  30 
 
 		 451 aa  212  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  29.72 
 
 		 451 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  29.78 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  29.72 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  29.72 
 
 		 451 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  29.5 
 
 		 451 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  29.72 
 
 		 451 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  30.31 
 
 		 452 aa  209  7e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  27.93 
 
 		 451 aa  209  9e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  31.21 
 
 		 448 aa  209  9e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  32.03 
 
 		 449 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  31.32 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 440 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  31.32 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  30.65 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  31.79 
 
 		 442 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  33.04 
 
 		 447 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  30.18 
 
 		 439 aa  205  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  29.39 
 
 		 465 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.91 
 
 		 467 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  31.09 
 
 		 451 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.09 
 
 		 451 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.13 
 
 		 460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  32.82 
 
 		 464 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  31.68 
 
 		 459 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  32.53 
 
 		 467 aa  194  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  30.54 
 
 		 459 aa  193  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  28.99 
 
 		 456 aa  193  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  31.42 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  29.08 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  31.26 
 
 		 459 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  28.72 
 
 		 472 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  26.55 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  26.97 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  31.28 
 
 		 453 aa  186  6e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  30.81 
 
 		 440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  29.57 
 
 		 455 aa  182  7e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  28.06 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  29.04 
 
 		 460 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  30.34 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  27.78 
 
 		 468 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>